MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2769977504 · doi:10.1021/jacs.7b07047

Fluorogenic Targeting of Voltage-Sensitive Dyes to Neurons

2017· article· en· W2769977504 sur OpenAlexfundno aff
Pei Liu, Vincent Grenier, Woo-Tack Hong, Vikram R. Muller, Evan W. Miller

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUC Berkeley College of ChemistryNational Institutes of HealthAgency for Science, Technology and ResearchUniversity of California BerkeleyEsther A. and Joseph Klingenstein FundSimons FoundationAlfred P. Sloan Foundation
Mots-clésChemistryFluorescenceEnzymeBiophysicsNeuronBiochemistryIn vitroCellNeuroscienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present a method to target voltage-sensitive fluorescent dyes to specified cells using an enzyme-catalyzed fluorogenic reaction on cell surfaces. The dye/enzyme hybrids are composed of a photoinduced electron transfer (PeT)-based fluorescent voltage indicator and a complementary enzyme expressed on the cell surface. Action of the exogenous enzyme on the dye results in fluorogenic activation of the dye, enabling fast voltage imaging in defined neurons with sensitivity surpassing those of purely genetically encoded approaches. We employ a bulky methylcyclopropylacetoxymethyl ether to diminish the fluorescence of a PeT-based voltage-sensitive dye, or VoltageFluor. The hydrolytically stable ether can be removed by the action of porcine liver esterase (PLE) to reveal the bright unmodified VoltageFluor. We established that the chemically modified VoltageFluor is a substrate for PLE in vitro and in live cells. When PLE is targeted to the external face of cell membranes, it controls the apparent staining of cells. The use of neuron-specific promoters can direct staining to mammalian neurons to provide clear detection of neuronal action potentials in single trials. All of the new VoltageFluors targeted by esterase expression (VF-EXs) report single spikes in cultured mammalian neurons. The best, VF-EX2, does so with a signal-to-noise ratio nearly double that of comparable genetically encoded voltage reporters. By targeting PLE to neurons, VF-EX2 can interrogate the neuromodulatory effects of serotonin in cultured hippocampal neurons. Taken together, our results show that a combination of synthetic chemistry and biochemistry enables bright and fast voltage imaging from genetically defined neurons in culture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Chemical SocietyMême sujetPhotoreceptor and optogenetics researchTravaux en français237 207