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Enregistrement W2770220785 · doi:10.1038/s41598-017-17079-6

Cell-Free DNA Kinetics in a Pre-Clinical Model of Head and Neck Cancer

2017· article· en· W2770220785 sur OpenAlexafffund
Nidal Muhanna, Marco A. Di Grappa, Harley Chan, Tahsin M. Khan, Cheng Jin, Yangqiao Zheng, Jonathan C. Irish, Scott V. Bratman

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesPrincess Margaret Cancer Foundation
Mots-clésHead and neck squamous-cell carcinomaLymph nodeMedicineHead and neck cancerCancerPathologyCancer researchTumour heterogeneityCell-free fetal DNAHead and neckOncologyInternal medicineBiologySurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In cancer patients, circulating tumour-derived DNA (ctDNA) levels imperfectly reflect disease burden apparent on medical imaging. Further evaluation of ctDNA levels over time is needed to better understand the correlation with tumour growth and therapeutic response. We describe ctDNA kinetics within an orthotopic, immunocompetent preclinical rabbit model of local-regionally advanced head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC). Monitoring primary tumour and metastatic lymph node volume by computed tomography (CT), we observed a correlation between ctDNA levels and tumour burden. We found that ctDNA detection could precede evidence of tumour on CT. Sensitivity and specificity of ctDNA detection in this model was 90.2% (95% C.I.: 76.9-97.3%) and 85.7% (95% C.I.: 67.3-96.0%), respectively. Rapid tumour growth followed by auto-necrosis and tumour volume contraction produced a spike in ctDNA levels, suggesting that viable tumour cells may be required for sustained ctDNA release. Following surgical resection, both ctDNA and total plasma DNA were correlated with recurrent tumour volume. Our results reveal the complex kinetic behaviour of ctDNA and total plasma DNA upon tumour growth or surgery. This pre-clinical model could be useful for future studies focused on elucidating mechanisms of ctDNA release into the circulation from primary and metastatic sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,354

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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