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Enregistrement W2771347360 · doi:10.1093/ibd/17.supplement1.s64

Exploring the reliability of phenotypic assignment for pediatric inflammatory bowel disease.

2011· article· en· W2771347360 sur OpenAlexaffabout
Mary Sherlock, Thomas D. Walters, George Tomlinson, David R. Urbach, Anne M. Griffiths

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensToronto General HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInflammatory bowel diseasePhenotypeMedicineDiseaseReliability (semiconductor)Inflammatory Bowel DiseasesClinical phenotypeImmunologyIntensive care medicineInternal medicineBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Montreal Classification1 was developed to provide a uniform system of designating subgroups of patients with inflammatory bowel disease (IBD), with the aim of facilitating multi-center genotype-phenotype correlation studies. Although the classification is frequently used for pediatric IBD patients, its reliability in this population has never been evaluated. To determine the reproducibility with which experienced IBD clinical researchers apply the Montreal Classification in pediatric settings. Case scenarios were constructed using de-identified data from the medical records of 50, randomly-selected, pediatric IBD patients. Data pertaining to clinical presentation, radiologic and endoscopic investigations were recorded. International IBD experts classified these cases using the Montreal Classification on two separate occasions. Inter-rater and intra-rater reliability in the assignment of an overall diagnosis of Crohn's disease (CD), ulcerative colitis (UC) or inflammatory bowel disease - type undefined (IBDU) were determined using the kappa statistic. The single kappa statistic for inter-rater reliability, which summarizes the level of agreement amongst all raters, was calculated using a SAS® Macro2. The kappa statistic for intra-rater reliability was determined for each rater individually using standard SAS® coding. A kappa value of > 0.6 and > 0.8 was considered to indicate good (or moderate) and excellent reliability respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,073
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,241
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0730,241
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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