Exploring the reliability of phenotypic assignment for pediatric inflammatory bowel disease.
Notice bibliographique
Résumé
The Montreal Classification1 was developed to provide a uniform system of designating subgroups of patients with inflammatory bowel disease (IBD), with the aim of facilitating multi-center genotype-phenotype correlation studies. Although the classification is frequently used for pediatric IBD patients, its reliability in this population has never been evaluated. To determine the reproducibility with which experienced IBD clinical researchers apply the Montreal Classification in pediatric settings. Case scenarios were constructed using de-identified data from the medical records of 50, randomly-selected, pediatric IBD patients. Data pertaining to clinical presentation, radiologic and endoscopic investigations were recorded. International IBD experts classified these cases using the Montreal Classification on two separate occasions. Inter-rater and intra-rater reliability in the assignment of an overall diagnosis of Crohn's disease (CD), ulcerative colitis (UC) or inflammatory bowel disease - type undefined (IBDU) were determined using the kappa statistic. The single kappa statistic for inter-rater reliability, which summarizes the level of agreement amongst all raters, was calculated using a SAS® Macro2. The kappa statistic for intra-rater reliability was determined for each rater individually using standard SAS® coding. A kappa value of > 0.6 and > 0.8 was considered to indicate good (or moderate) and excellent reliability respectively.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,073 | 0,241 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».