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Enregistrement W2771417165 · doi:10.24870/cjb.2017-a228

Docking Studies of Hispolon Mediated Human NF-κβ Inhibition and In-Silico Development of Hispolon Derivatives Towards Cancer Treatment

2017· article· en· W2771417165 sur OpenAlexvenueno aff
Hrudayanath Thatoi, Mrunmaya Kumar Panda, Manish Paul

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Biotechnology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIn silicoPhellinus linteusDocking (animal)CancerApoptosisChemistryCancer researchComputational biologyBiologyBiochemistryMedicineMyceliumGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In-silico drug designing for better anticancer therapeutics targeting human NF-κB, a pivotal enzyme involved in cancer regulating pathway. Hispolon, a black hoof mushroom (Phellinus linteus) or shaggy bracket mushroom (Inonotus hispidus) derived polyphenolic compound is structurally homologous with Curcumin and possess the NF-κB inhibitory efficiency as an anticancer agent. However, the in-silico studies related to Hispolon mediated inhibition of NF-κB activity and its mechanism of action has not yet been investigated so far. The present paper reports in-silico studies carried out to investigate the detailed mechanism of Hispolon mediated inhibition of NF-κB and designing of new potent derivatives of Hispolon having anticancer activity. Docking, Binding free energy analysis, Drug designing ADMET and IC50 has been performed for the fulfilment of above mentioned objective. DRG2 compound (ΔG= -30.180 kcal/mol) is the most potent in binding with human NF-κB among all 10 designed Hispolon derivatives. Met469 and Glu470 of human NF-κB makes an additional interaction with one of the hydrogen atom of 5-methoxy group of ligand’s benzene ring. Methoxy group placed on the -ortho and two -para position of benzene ring and the –meta positioned hydroxyl group of the compound plays crucial role in strengthening the binding energy with human NF-κB. ADMET analysis also confirmed the drug-likeness and efficiency of DRG2 with NF-κB. In-depth structural, molecular modelling, docking and binding energy studies helps to redesign Hispolon to better compound that might have some additional inhibitory effect on human NF-κB thus can be used as anticancer therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,936

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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Résumé présentoui

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