Entangled evolutionary history of <i>Cuscuta pentagona</i> clade: A story involving hybridization and Darwin in the Galapagos
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The distribution of Cuscuta subg. Grammica sect. Cleistogrammica (Cuscuta pentagona clade) is centered in North America (C. campestris, C. glabrior, C. harperi, C. pentagona, C. obtusiflora, C. plattensis, C. polygonorum, C. runyonii); however, long ‐distance dispersal was documented to Hawaii (C. sandwichiana), South America (C. gymnocarpa, C. stenolepis, and in part C. obtusiflora), Africa (C. bifurcata, C. schlechteri), Eurasia, and Australia (C. australis). Hybrid speciation has already been documented for some members of sect. Cleistogrammica (C. sandwichiana, C. bifurcata) but previous studies strongly suggested that the extent of reticulate evolution is underestimated in Cuscuta generally, and in this section in particular. Sequence data from the nuclear internal transcribed spacer (ITS) and the plastid trnL‐F region were used to reconstruct the phylogeny and gain a better understanding of the evolutionary history within the clade. Additionally, a morphometric analysis was conducted to test the phenetic distinctiveness of a select number of species with taxonomic problems: C. campestris, C. glabrior, C. gymnocarpa, and C. pentagona. Discordances between phylogenies derived from plastid and nuclear data showed that C. campestris is a hybrid, likely involving the C. runyonii / glabrior lineage as a maternal progenitor and an undiscovered species as a paternal progenitor. This latter species, an extinct or unsampled lineage, was itself inferred to be a hybrid between C. pentagona / harperi and C. australis / obtusiflora / polygonorum lineages. Both the evolutionary and morphometric results clearly showed that C. campestris is a distinct species and the negative consequences of its amalgamation with C. pentagona during the last decades are discussed. Cuscuta gymnocarpa, an enigmatic species described from specimens collected by Darwin from the Galapagos, was inferred as conspecific with C. campestris and proposed as a variety of the latter. Because C. gymnocarpa is only a form of C. campestris, the possible means of dispersal of the latter species to the Galapagos are discussed. Cuscuta modesta, a new species discovered while studying the systematics of the clade, is described and illustrated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».