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Enregistrement W2771840278 · doi:10.1071/rdv30n1ab175

175 Testis-Specific Protein Y Encoded Copy Number Variation in In Vitro-Produced Bovine Early Embryos

2017· article· en· W2771840278 sur OpenAlexaffabout
N. Y. Rho, Laura A. Favetta, T. Mogas, W.A. King

Notice bibliographique

RevueReproduction Fertility and Development · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensUniversity of GuelphGreo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlastocystBiologyTestis determining factorAndrologyZygoteEmbryo cultureSemenEmbryoY chromosomeTheriogenologyReproductive technologyTransgenesisGeneticsSpermatogenesisGeneMolecular biologyEmbryogenesisEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Testis-specific protein Y (TSPY) is one of the genes located in the male-specific region of the Y chromosome involved in male reproduction, particularly in spermatogenesis. It has been shown to have different copy number (CN) in different species, in different individuals within a species and in the same family (i.e. among brothers from the same father). Previous studies from our laboratory in the bovine species showed that different TSPY CN was correlated with fertility, as bulls with higher CN showed higher fertility rate. In this study, we investigated development rate in in vitro-produced (IVP) bovine early embryos produced by sex-sorted semen (X and Y) from 3 bulls (1, 2, and 3) and TSPY copy number variation (CNV) in the male blastocysts. The IVP embryos by the 3 different types of semen (sub-divided: 1X, 1Y, 2X, 2Y, 3X, 3Y) and parthenotes (PART) for the negative control were assessed for developmental rates (shown in Table 1 below) and individually collected at each cell stage from zygote to blastocyst to extract DNA for TSPY CN analysis. The DNA from individual blastocysts was treated with a restriction enzyme for relative quantification of TSPY CN using digital droplet PCR (ddPCR) with SRY, known to have only one copy in bovine, as a reference gene. Developmental data showed that Y-carrying semen had higher rates both in cleavage and blastocyst compared with X-carrying semen from the same bull. Particularly, bull 3 (both 3X and 3Y) had the highest developmental rates compared with the other 2 types of bulls. TSPY was detected in male blastocyst, where both parthenotes and female embryos were negative. Relative CN of TSPY versus SRY from blastocysts produced from bulls 1, 2, and 3 averaged to 87.5, 55, and 20, respectively. Interestingly, the CN among brother blastocysts showed a variation of less than 7.5, where bull-to-bull variation was approximately from 20 to 60 copies. Our results show that TSPY CN in the embryo varies according to the sire and among brother blastocysts. Moreover, TSPY CNV among brother blastocysts allows us to speculate that individually different recombination events occurred in meiosis during spermatogenesis. Table 1. Embryo development rate by semen type This research was funded by the Canada Research Chair’s program, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada and the Ontario Veterinary College.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,492
Score d'incertitude au seuil0,734

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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