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Enregistrement W2772192734 · doi:10.1063/1.5002145

Stability of the helical configuration of an intrinsically straight semiflexible biopolymer inside a cylindrical cell

2017· article· en· W2772192734 sur OpenAlexafffund
Zicong Zhou, Béla Joós, Chen‐Xu Wu

Notice bibliographique

RevueAIP Advances · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Science and Technology of the People's Republic of China
Mots-clésHelix (gastropod)BiopolymerProtein filamentTorqueMreBMaterials scienceCondensed matter physicsChemical physicsMechanicsClassical mechanicsPhysicsNanotechnologyChemistryPolymerThermodynamicsComposite materialCellCytoskeleton

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We examine the effects of the external force, torque, temperature, confinement, and excluded volume interactions (EVIs) on the stability of the helical configuration of an intrinsically straight semiflexible biopolymer inside a cylindrical cell. We find that to stabilize a helix, the confinement from both ends of the cell is more effective than a uniaxial force. We show that under a uniaxial force and in absence of confinement from bottom of the cell, a stable helix is very short. Our results reveal that to maintain a low pitch helix, a torque acting at both ends of the filament is a necessity, and the confinement can reduce the required torque to less than half making it much easier to form a stable helix. Moreover, we find that thermal fluctuations and EVIs have little impact on the stability of a helix. Our results can help understand the existence of the helix and ring configurations of some semiflexible biopolymers, such as MreB homologs, inside a rod-shaped bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,241

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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