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Enregistrement W2772305927 · doi:10.1371/journal.pone.0188817

Cytotoxicity of portoamides in human cancer cells and analysis of the molecular mechanisms of action

2017· article· en· W2772305927 sur OpenAlexfundno aff
Tiago Ribeiro, Filipa Lemos, Marco Preto, Joana Azevedo, Maria Lígia Sousa, Pedro N. Leão, Alexandre Campos, Stig Linder, Rui Vitorino, Vı́tor Vasconcelos, Ralph Urbatzka

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundFundação para a Ciência e a TecnologiaWilfrid Laurier UniversityDepartment of Physical Therapy, Western Michigan University
Mots-clésBiologyMitochondrionBiochemistryCell cultureOxidative phosphorylationCancer cellOxidative stressCell biologyGlutathioneCancerEnzymeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Portoamides are cyclic peptides produced and released by the cyanobacterial strain Phormidium sp. presumably to interfere with other organisms in their ecosystems ("allelopathy"). Portoamides were previously demonstrated to have an antiproliferative effect on human lung carcinoma cells, but the underlying mechanism of this activity has not been described. In the present work, the effects of portoamides on proliferation were examined in eight human cancer cell lines and two non-carcinogenic cell lines, and major differences in sensitivities were observed. To generate hypotheses with regard to molecular mechanisms of action, quantitative proteomics using 2D gel electrophoresis and MALDI-TOF/TOF were performed on the colon carcinoma cell line HT-29. The expression of proteins involved in energy metabolism (mitochondrial respiratory chain and pentose phosphate pathway) was found to be affected. The hypothesis of altered energy metabolism was tested in further experiments. Exposure to portoamides resulted in reduced cellular ATP content, likely due to decreased mitochondrial energy production. Mitochondrial hyperpolarization and reduced mitochondrial reductive capacity was observed in treated cells. Furthermore, alterations in the expression of peroxiredoxins (PRDX4, PRDX6) and components of proteasome subunits (PSB4, PSA6) were observed in portoamide-treated cells, but these alterations were not associated with detectable increases in oxidative stress. We conclude that the cytotoxic activity of portoamides is associated with disturbance of energy metabolism, and alterations in mitochondrial structure and function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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