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Enregistrement W2773167758 · doi:10.9778/cmajo.20170041

Rates of colonization with extended-spectrum β-lactamase-producing <i>Escherichia coli</i> in Canadian travellers returning from South Asia: a cross-sectional assessment

2017· article· en· W2773167758 sur OpenAlexaffvenueabout
Gisele Peirano, Daniel B. Gregson, Susan Kuhn, Otto G. Vanderkooi, Diego B. Nóbrega, Johann Pitout

Notice bibliographique

RevueCMAJ Open · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOdds ratioConfidence intervalDemographyColonizationMedicinePopulationEscherichia coliBeta-lactamaseVeterinary medicineInternal medicineMicrobiologyEnvironmental healthBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: A previous study in Calgary showed that travel to India was associated with high risk of community-onset infections with extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli. We performed a follow-up study to determine the rate of rectal acquisition of ESBL-producing E. coli among travellers to South Asia and to identify the behaviours putting such travellers at high risk for acquiring ESBL-producing E. coli. Methods: The study was performed at a travel clinic in Calgary. Travellers 18 years or older who were planning to visit South Asia for a period of at least 5 days were included. Three rectal swabs were obtained, and 2 questionaires were administered (before and after travel). Results: A total of 149 travellers participated between January 2012 and July 2014; of these, 116 (78%) provided rectal swabs upon return to Calgary and completed both pre- and post-travel questionaires. Of the 109 travellers without colonization with ESBL-producing E. coli upon enrollment, 70 (64%) acquired ESBL-producing E. coli during travel. Of the 90 participants who visited India, 66 (73%) were positive for ESBL-producing E. coli upon their return to Calgary. Most ESBL-producing E. coli specimens were identified as producing the enzyme CTX-M-15. Behaviours associated with a statistically significant risk of acquiring ESBL-producing E. coli included visiting India (odds ratio [OR] 19.9, 95% confidence interval [CI] 4.5-88.8), consuming meals with the local population (OR 6.9, 95% CI 1.2-39.6), taking any type of antibiotic during travel (OR 4.3, 95% CI 1.3-14.3) and travelling for any purpose other than business (OR 12.4, 95% CI 2.8-55.2). Interpretation: In this study, travel to India was associated with the highest risk of acquiring ESBL-producing E. coli relative to travel to other countries in South Asia. Nonbusiness travel, consuming foods with the local population and the use of antibiotics while travelling were associated with an increased risk of acquiring these antibiotic-resistant organisms while in India. Trial registration: ClinicalTrials.gov, no. NCT01296165.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,218

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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