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Enregistrement W2774745410 · doi:10.1093/ibd/17.supplement1.s25b

Osteopontin is associated with Citrobacter rodentium attachment and formation of attaching-effacing lesions.

2011· article· en· W2774745410 sur OpenAlexaff
A. Tang, L Liu, Eytan Wine

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitrobacter rodentiumCitrobacterMicrobiologyOsteopontinPathologyMedicineBiologyImmunologyEnterobacteriaceaePathogenEscherichia coliBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osteopontin (OPN) is a complex glyco-phosphoprotein implicated in a number of biological processes, including inflammatory and autoimmune conditions. OPN is increased in the serum and mucosa of patients with inflammatory bowel diseases (IBD) and mediates innate and adaptive immunity in human disease and animal models of inflammation. However, the role of OPN in IBD pathogenesis is yet to be defined. Recently we showed that OPN−/− mice are partially protected from colitis induced by Citrobacter rodentium (an infectious model of IBD), as indicated by reduced epithelial cell hyperplasia and bacterial colonization of infected mice when OPN was absent. Therefore, our hypothesis was that OPN mediates gut inflammation by promoting bacterial attachment to cells. The objective of this study was to determine the potential effect of OPN on bacterial attachment and the formation of attaching-effacing (A/E) lesions induced by C. rodentium infection. HeLa, NIH 3T3, and HT-29 cells were incubated with C. rodentium for 4 h and then fixed and stained with phalloidin (to visualise actin in A/E lesions), anti-OPN antibody, and DAPI. Co-localization of bacteria, A/E lesions, and OPN was examined using laser confocal immunofluorescence microscopy. Effects of OPN on A/E lesions were assessed by addition of varying concentrations of bovine or recombinant OPN to the growth medium and enumeration of A/E lesions using systematic quantification. HeLa cells were transfected with a FLAG-tagged OPN-expression vector, and then incubated with C. rodentium to assess effects of OPN over-expression on A/E lesions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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