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Enregistrement W2776686103 · doi:10.1073/pnas.1711141115

Epigenetic control of pheromone MAPK signaling determines sexual fecundity in <i>Candida albicans</i>

2017· article· en· W2776686103 sur OpenAlexaff
Christine M. Scaduto, Shail Kabrawala, Grégory Thomson, William L. Scheving, Andy Ly, Matthew Z. Anderson, Malcolm Whiteway, Richard J. Bennett

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesBurroughs Wellcome Fund
Mots-clésCandida albicansEpigeneticsBiologyMAPK/ERK pathwaySignal transductionCell biologySexual reproductionMatingCarcinogenesisGeneticsCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance A central theme in biology is to understand how different signaling outputs can be accomplished by changes to signal transduction pathways. Here, we examined epigenetic differences between two cell states in the human fungal pathogen Candida albicans . We show that cells in the “white” state are sterile due to multiple bottlenecks in MAPK signaling relative to mating-competent “opaque” cells. Alleviation of these bottlenecks by reverse engineering effectively converts sterile white cells into sexually competent cells. These results have broad implications for understanding how epigenetic changes can impact MAPK expression and signaling output, including events associated with tumorigenesis. We also propose a model for how the white-opaque switch gained control of sexual reproduction in Candida during evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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