Cardiolipin synthase A colocalizes with cardiolipin and osmosensing transporter ProP at the poles of <i>Escherichia coli</i> cells
Notice bibliographique
Résumé
Osmosensing by transporter ProP is modulated by its cardiolipin (CL)-dependent concentration at the poles of Escherichia coli cells. Other contributors to this phenomenon were sought with the BACterial Two-Hybrid System (BACTH). The BACTH-tagged variants T18-ProP and T25-ProP retained ProP function and localization. Their interaction confirmed the ProP homo-dimerization previously established by protein crosslinking. YdhP, YjbJ and ClsA were prominent among the putative ProP interactors identified by the BACTH system. The functions of YdhP and YjbJ are unknown, although YjbJ is an abundant, osmotically induced, soluble protein. ClsA (CL Synthase A) had been shown to determine ProP localization by mediating CL synthesis. Unlike a deletion of clsA, deletion of ydhP or yjbJ had no effect on ProP localization or function. All three proteins were concentrated at the cell poles, but only ClsA localization was CL-dependent. ClsA was shown to be N-terminally processed and membrane-anchored, with dual, cytoplasmic, catalytic domains. Active site amino acid replacements (H224A plus H404A) inactivated ClsA and compromised ProP localization. YdhP and YjbJ may be ClsA effectors, and interactions of YdhP, YjbJ and ClsA with ProP may reflect their colocalization at the cell poles. Targeted CL synthesis may contribute to the polar localization of CL, ClsA and ProP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».