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Enregistrement W2780601052 · doi:10.1038/sdata.2017.181

An open resource for transdiagnostic research in pediatric mental health and learning disorders

2017· article· en· W2780601052 sur OpenAlexaff
Lindsay Alexander, Jasmine Escalera, Lei Ai, Charissa Andreotti, Karina Febre, Alexander Mangone, Natan Vega Potler, Nicolas Langer, Alexis Alexander, Meagan Kovacs, Shannon Litke, Bridget O’Hagan, J. E. Andersen, Batya Bronstein, Anastasia Bui, Marijayne Bushey, H. W. Butler, Victoria Castagna, Nicolas L. Camacho, Elisha Chan, Danielle Citera, Jon Clucas, Samantha Cohen, Sarah Dufek, Megan Eaves, Brian Fradera, Judith Gardner, Natalie Grant-Villegas, Gabriella Green, Emily Hart, Shana Harris, Megan K. Horton, Danielle Kahn, Katherine E. Kabotyanski, Bernard Z. Karmel, Simon P. Kelly, Kayla Kleinman, Bonhwang Koo, Eliza Kramer, Elizabeth M. Lennon, Catherine Lord, Ginny Mantello, Amy Margolis, Kathleen R. Merikangas, Judith Milham, Giuseppe Minniti, Rebecca Neuhaus, Alexandra M. Levine, Yael Osman, Lucas C. Parra, Ken Pugh, Amy Racanello, Anita Restrepo, Tian Saltzman, Batya Septimus, Russell H. Tobe, Rachel Waltz, Anna Williams, Anna J. Yeo, F. Xavier Castellanos, Arno Klein, Tomáš Paus, Bennett L. Leventhal, R. Cameron Craddock, Harold S. Koplewicz, Michael P. Milham

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensBaycrest HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesStavros Niarchos FoundationNational Institute of Environmental Health SciencesChild Mind InstituteStrongHearst Foundations
Mots-clésBiobankNeuroimagingOpen scienceMental healthPsychologyPsychopathologyData sharingData scienceComputer scienceMedicinePsychiatryBioinformaticsAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Technological and methodological innovations are equipping researchers with unprecedented capabilities for detecting and characterizing pathologic processes in the developing human brain. As a result, ambitions to achieve clinically useful tools to assist in the diagnosis and management of mental health and learning disorders are gaining momentum. To this end, it is critical to accrue large-scale multimodal datasets that capture a broad range of commonly encountered clinical psychopathology. The Child Mind Institute has launched the Healthy Brain Network (HBN), an ongoing initiative focused on creating and sharing a biobank of data from 10,000 New York area participants (ages 5-21). The HBN Biobank houses data about psychiatric, behavioral, cognitive, and lifestyle phenotypes, as well as multimodal brain imaging (resting and naturalistic viewing fMRI, diffusion MRI, morphometric MRI), electroencephalography, eye-tracking, voice and video recordings, genetics and actigraphy. Here, we present the rationale, design and implementation of HBN protocols. We describe the first data release (n=664) and the potential of the biobank to advance related areas (e.g., biophysical modeling, voice analysis).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,025
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,088
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,570

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0250,088
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0080,009
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0040,005
Science ouverte0,0040,016
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1700,064

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,303
Tête enseignante GPT0,462
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations723
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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