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Enregistrement W2781122577 · doi:10.1107/s0108767317096544

Structural and functional studies of strigolactone receptors of <i>Striga hermonthica</i>, its adaptation and evolution

2017· article· en· W2781122577 sur OpenAlexaff
Amir Arellano-Saab, P.J. Stogios, Alexei Savchenko, Peter McCourt

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStrigaStriga hermonthicaAdaptation (eye)BiologyBotanyNeuroscienceGermination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Striga spp. is a genus of obligate root-parasitic plants, with the ability to deplete host roots from water, carbohydrates, and other essential nutrients. There are around 30-35 species within the genus, and at least 80% of them are found in Africa. The most destructive species found in Africa is Striga hermonthica, with the ability to parasite major food crops, such as rice, millet, maize, and sorghum, producing high yield losses ranging from 30% to 100% of the crops (Berner, Kling, & Singh, 1995). Nowadays, the most common method to eliminate the parasitic plants is hand weeding, which is time-consuming, labour-intensive, and not very effective. It is thought that a complete understanding of the germination mechanism of Striga is necessary to develop targeted strategies to attack this weed. It has been proven that the germination of parasitic plants such as Striga and Orobanche is triggered by chemical factors called strigolactones (Toh et al., 2015). Although the strigolactone receptor system has been studied, it is not completely characterized yet. It is known that the system is composed of 11 different receptors and each of them presents variable sensitivities to strigolactones. Several attempts to crystallize these receptors have been made, but only two structures have been reported so far, ShHTL3 (Xu et al., 2016) and ShHTL5 (Toh et al., 2015). It is essential to reveal the structural differences between the ShHTL receptors to understand its particular role in the strigolactone detection and establish the molecular basis for this detection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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Résumé présentoui

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