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Enregistrement W2782441719 · doi:10.5539/jmbr.v8n1p8

Novel Mycoplasma Agalactiae with new P30 Protein Pattern by Major Change in 17 Amino Acids

2018· article· en· W2782441719 sur OpenAlexvenueno aff
M Babazadeh, S A Pourbakhsh, Zahra Noormohammadi, Majid Esmaelizad, Hamid Reza Goudarzi

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRazi Vaccine and Serum Research Institute
Mots-clésGenBankBiologyMicrobiologyGeneVirologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

M. agalactiae (Mycoplasma agalactiae) is the main agent of CA (contagious agalactia) that is primarily disease of dairy sheep and goats. In Iran, a three-valent Agalactia inactivated vaccine were prepared based on three M. agalactiae isolated from milk secretion of sheep and goat of Taleghan, Shiraz and Lorestan and preventive policies against CA disease founded in Razi Institute since 1966. The P30 is a specific and stable lipoprotein of M. agalactiae. In this study, complete coding sequence of P30 gene of three Iranian vaccine strains and ten recently field isolates were analyzed in nucleotide and protein levels by bioinformatics tools. Interestingly, results observed a novel protein pattern K106VLKTKEIRLSQERKLS122 in P30 protein of vaccine strains compared to field isolates and the other available sequences in GenBank. Our findings demonstrated different B and T cell epitope patterns in Iranian vaccine strains. We suggested that the major change in P30 protein pattern may be occurred due to mutation during adaptation process in PPLO (Pleuropneumonia-Like Organisms) broth media.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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