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Identification of genetic elements in metabolism by high-throughput mouse phenotyping
Jan Rozman, Birgit Rathkolb, Manuela A. Oestereicher, Christine Schütt, Aakash Chavan Ravindranath, Stefanie Leuchtenberger, Sapna Sharma, Martin Kistler, Monja Willershäuser, Robert Brommage, Terrence F. Meehan, Jeremy Mason, Hamed Haselimashhadi, Juan Antonio Aguilar‐Pimentel, Lore Becker, Irina Treise, Kristin Moreth, Lillian Garrett, Sabine M. Hölter, Annemarie Zimprich, Susan Marschall, Oana V. Amarie, Julia Calzada-Wack, Frauke Neff, Laura Brachthäuser, Christoph Lengger, Claudia Stoeger, Lilly Zapf, Yi-Li Cho, Patricia da Silva‐Buttkus, Markus Kraiger, Philipp Mayer‐Kuckuk, Karen Kristine Gampe, Moya Wu, Nathalie Conte, Jonathan Warren, Chao-Kung Chen, Ilinca Tudose, Mike Relac, Peter Matthews, Heather Cater, Helen P. M. Natukunda, James Cleak, Lydia Teboul, Sharon Clementson-Mobbs, Zsombor Szoke-Kovacs, Alison P. Walling, Sara Johnson, Gemma Codner, Tanja Fiegel, Natalie Ring, Henrik Westerberg, Simon Greenaway, Duncan Sneddon, Hugh W. Morgan, Jorik Loeffler, Michelle Stewart, Ramiro Ramírez‐Solis, Allan Bradley, William C. Skarnes, Karen P. Steel, Simon A. Maguire, Joshua Dench, David Lafont, Valerie E. Vancollie, Selina Pearson, Amy S. Gates, Mark Sanderson, Carl Shannon, Lauren F. E. Anthony, Maksymilian T. Sumowski, Robbie S. B. McLaren, Brendan Doe, Hannah Wardle‐Jones, Mark Griffiths, Antonella Galli, Agnieszka Świątkowska, Christopher Isherwood, Anneliese O. Speak, Emma L. Cambridge, Heather Wilson, Susana Caetano, Anna Karin B. Maguire, David J. Adams, Joanna Bottomley, Edward J. Ryder, Diane Gleeson, Laurent Pouilly, Stéphane Rousseau, Aurélie Auburtin, Patrick T. Reilly, Abdel Ayadi, Mohammed Selloum, Joshua A. Wood, Dave Clary, Peter J. Havel, Todd Tolentino, Heather Tolentino, Mike Schuchbauer, Sheryl Pedroia, Amanda Trainor, Esi Djan, Milton Pham, Alison Huynh, Vincent de Vera, John Seavitt, Juan Gallegos, Arturo Garza, Elise Mangin, Joel Senderstrom, Iride Lazo, Kate Mowrey, Ritu Bohat, Rodney C. Samaco, Surabi Veeraragavan, Christine Beeton, Sowmya Kalaga, Lois Kelsey, Igor Vukobradovic, Zorana Berberovic, Celeste Owen, Dawei Qu, Ruolin Guo, Susan Newbigging, Lily Morikawa, Napoleon Law, Xueyuan Shang, Patricia Feugas, Yanchun Wang, Mohammad Eskandarian, Yingchun Zhu, Patricia Penton, Valerie Laurin, Shannon Clarke, Qing Lan, Gillian Sleep, Amie Creighton, Elsa Jacob, Ozge Danisment, Marina Gertsenstein, Monica Pereira, S. MacMaster, Sandra Tondat, Tracy Carroll, Jorge Cabezas, Jane Hunter, Greg Clark, Mohammed Bubshait, David Miller, Khondoker Sohel, Hibret A. Adissu, Milan Ganguly, Alexandr Bezginov, Francesco Chiani, Chiara Di Pietro, Gianfranco Di Segni, Olga Ermakova, Filomena Ferrara, Paolo Fruscoloni, Alessia Gambadoro, Serena Gastaldi, Elisabetta Golini, Gina La Sala, Silvia Mandillo, Daniela Marazziti, Marzia Massimi, Rafaele Matteoni, Tiziana Orsini, Miriam Pasquini, Marcello Raspa, Aline Rauch, Gianfranco Rossi, Nicoletta Rossi, Sabrina Putti, Ferdinando Scavizzi, Giuseppe D. Tocchini-Valentini, Shigeharu Wakana, Tomohiro Suzuki, Masaru Tamura, Hideki Kaneda, Tamio Furuse, Kimio Kobayashi, Ikuo Miura, Ikuko Yamada, Yuichi Obata, Atsushi Yoshiki, Shinya Ayabe, J. Nicole Chambers, Karel Chalupský, Claudia Seisenberger, Antje Bürger, Joachim Beig, Ralf Kühn, Andreas Hörlein, Joel Schick, Oskar Oritz, Florian Giesert, Jochen Graw, Markus Ollert, Carsten B. Schmidt‐Weber, Tobias Stoeger, Ali Önder Yildirim, Oliver Eickelberg, Thomas Klopstock, Dirk H. Busch, Raffi Bekeredjian, Andreas Zimmer, Damian Smedley, Mary E. Dickinson, Frank Benso, Iva Morse, Hyoung-Chin Kim, Ho Lee, Soo Young Cho, Tertius Hough, Ann‐Marie Mallon, Sara Wells, Luís Santos, Christopher J. Lelliott, Jacqueline K. White, Tania Sorg, Marie‐France Champy, Lynette Bower, Corey Reynolds, Ann M. Flenniken, Stephen A. Murray, Lauryl M. J. Nutter, Karen L. Svenson, Glauco P. Tocchini‐Valentini, Arthur L. Beaudet, Fátima Bosch, Robert Braun, Michael S. Dobbie, Xiang Gao, Yann Hérault, Ala Moshiri, Bret A. Moore, K. C. Kent Lloyd, Colin McKerlie, Hiroshi Masuya, Nobuhiko Tanaka, Paul Flicek, Helen Parkinson, Radislav Sedláček, Je Kyung Seong, Chi‐Kuang Leo Wang, Mark W. Moore, Steve D. M. Brown, Matthias H. Tschöp, Wolfgang Wurst, Martin Klingenspor, Eckhard Wolf, Johannes Beckers, Fausto Machicao, Andreas Peter, Harald Staiger, Hans‐Ulrich Häring, Harald Grallert, Mónica Campillos, Holger Maier, Helmut Fuchs, Valerie Gailus-Durner, Thomas Werner, Martin Hrabě de Angelis
Notice bibliographique
RevueNature Communications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteToronto Centre for PhenogenomicsHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesFP7 HealthNational Center for Research ResourcesNational Eye InstituteNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilCentre National de la Recherche ScientifiqueBundesministerium für Bildung und ForschungUniversité de StrasbourgInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustAgence Nationale de la RecherchePHENOMINGovernment of CanadaGenome CanadaNational Institutes of HealthOntario GenomicsNational Research FoundationINFRAFRONTIERAustralian Government
Mots-clésIdentification (biology)Computational biologyThroughputGeneticsBiologyComputer science
Résumé
OpenAlex consigne un résumé pour ce travail, mais il n'a pas pu être récupéré à l'instant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,233
Score d'incertitude au seuil0,427
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations72
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui