Construction of an infectious horsepox virus vaccine from chemically synthesized DNA fragments
Notice bibliographique
Résumé
Edward Jenner and his contemporaries believed that his variolae vaccinae originated in horses and molecular analyses show that modern vaccinia virus (VACV) strains share common ancestry with horsepox virus (HPXV). Given concerns relating to the toxicity of modern VACV vaccines, we asked whether an HPXV-based vaccine might provide a superior alternative. Since HPXV may be extinct and the only specimen of HPXV that has been identified is unavailable for investigation, we explored whether HPXV could be obtained by large-scale gene synthesis. Ten large (10-30 kb) fragments of DNA were synthesized based on the HPXV sequence along with two 157 nt VACV terminal sequences, and were recombined into a live synthetic chimeric HPXV (scHPXV) in cells infected with Shope fibroma virus (SFV). Sequencing of the 212 kbp scHPXV confirmed it encoded a faithful copy of the input DNA. We believe this is the first complete synthesis of a poxvirus using synthetic biology approaches. This scHPXV produced smaller plaques, produced less extracellular virus and exhibited less virulence in mice than VACV, but still provided vaccine protection against a lethal VACV challenge. Collectively, these findings support further development of scHPXV as a novel replication-proficient smallpox vaccine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».