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Enregistrement W2783639731 · doi:10.1161/circgen.117.001758

ExomeChip-Wide Analysis of 95 626 Individuals Identifies 10 Novel Loci Associated With QT and JT Intervals

2018· review· en· W2783639731 sur OpenAlexfundno aff
Nathan A. Bihlmeyer, Jennifer A. Brody, Albert V. Smith, Helen R. Warren, Honghuang Lin, Aaron Isaacs, Ching‐Ti Liu, Jonathan Marten, Farid Radmanesh, Leanne M. Hall, Niels Grarup, Hao Mei, Martina Müller‐Nurasyid, Jennifer E. Huffman, Niek Verweij, Xiuqing Guo, Jie Yao, Ruifang Li‐Gao, Marten van den Berg, Stefan Weiß, Bram P. Prins, Jessica van Setten, Jeffrey Haessler, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Man Li, Álvaro Alonso, Elsayed Z. Soliman, Joshua C. Bis, Tom Austin, Yii-Der Ida Chen, Bruce M. Psaty, Tamara B. Harrris, Lenore J. Launer, Sandosh Padmanabhan, Anna F. Dominiczak, Paul L. Huang, Zhijun Xie, Patrick T. Ellinor, Jan A. Kors, Archie Campbell, Alison D. Murray, Christopher P. Nelson, Martin D. Tobin, Jette Bork‐Jensen, Torben Hansen, Oluf Pedersen, Allan Linneberg, Moritz F. Sinner, Annette Peters, Mélanie Waldenberger, Thomas Meitinger, Siegfried Perz, Ivana Kolčić, Igor Rudan, Rudolf A. de Boer, Peter van der Meer, Henry J. Lin, Kent D. Taylor, Renée de Mutsert, Stella Trompet, J. Wouter Jukema, Arie C. Maan, Bruno H. Stricker, Fernando Rivadeneira, André G. Uitterlinden, Uwe Völker, Georg Homuth, Henry Völzke, Stephan B. Felix, Massimo Mangino, Timothy D. Spector, Michiel L. Bots, Marco Perez, Olli T. Raitakari, Mika Kähönen, Nina Mononen, Vilmundur Guðnason, Patricia B. Munroe, Steven A. Lubitz, Cornelia M. van Duijn, Christopher Newton‐Cheh, Caroline Hayward, Jonathan Rosand, Nilesh J. Samani, Jørgen K. Kanters, James G. Wilson, Stefan Kääb, Ozren Polašek, Pim van der Harst, Susan R. Heckbert, Jerome I. Rotter, Dennis O. Mook‐Kanamori, Mark Eijgelsheim, Marcus Dörr, Yalda Jamshidi, Folkert W. Asselbergs, Charles Kooperberg, Terho Lehtimäki, Dan E. Arking, Nona Sotoodehnia

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2018
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCommon FundFP7 HealthInstitute of GeneticsNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Human Genome Research InstituteHelmholtz Zentrum MünchenNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesEuropean CommissionErasmus Universitair Medisch Centrum RotterdamNational Institutes of HealthHjartaverndNovo Nordisk Foundation Center for Basic Metabolic ResearchUniversité de GenèveMedical Research CouncilNational Institute of General Medical SciencesNierstichtingLeids Universitair Medisch CentrumDiabetes FondsDeutsches Zentrum für Herz-KreislaufforschungNetherlands Heart InstituteUniversitair Medisch Centrum GroningenCARIM School for Cardiovascular Diseases, Universiteit MaastrichtSiemensNational Institute of Mental HealthHorizon 2020 Framework ProgrammeHrvatska Zaklada za ZnanostNational Cancer InstituteLundbeckfondenBundesministerium für Bildung und ForschungHáskóli ÍslandsNIH Office of the DirectorUniversiteit LeidenUniversity of WashingtonMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenErasmus Medisch CentrumNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekDeutsche ForschungsgemeinschaftRijksuniversiteit GroningenUniversity of LeicesterSchool of Medicine, Boston UniversityBroad InstituteUniversiteit MaastrichtZonMwJohns Hopkins UniversityMassachusetts General HospitalNational Science FoundationNational Institute for Health and Care ResearchQueen Mary University of LondonHarvard UniversityUniversity of MiamiYale UniversityNational Institute on Drug AbuseNovo NordiskUniversity of Pennsylvania
Mots-clésQT intervalRepolarizationSudden cardiac deathInternal medicineCardiologyMedicineLong QT syndromeAfterdepolarizationElectrophysiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: QT interval, measured through a standard ECG, captures the time it takes for the cardiac ventricles to depolarize and repolarize. JT interval is the component of the QT interval that reflects ventricular repolarization alone. Prolonged QT interval has been linked to higher risk of sudden cardiac arrest. METHODS AND RESULTS: We performed an ExomeChip-wide analysis for both QT and JT intervals, including 209 449 variants, both common and rare, in 17 341 genes from the Illumina Infinium HumanExome BeadChip. We identified 10 loci that modulate QT and JT interval duration that have not been previously reported in the literature using single-variant statistical models in a meta-analysis of 95 626 individuals from 23 cohorts (comprised 83 884 European ancestry individuals, 9610 blacks, 1382 Hispanics, and 750 Asians). This brings the total number of ventricular repolarization associated loci to 45. In addition, our approach of using coding variants has highlighted the role of 17 specific genes for involvement in ventricular repolarization, 7 of which are in novel loci. CONCLUSIONS: Our analyses show a role for myocyte internal structure and interconnections in modulating QT interval duration, adding to previous known roles of potassium, sodium, and calcium ion regulation, as well as autonomic control. We anticipate that these discoveries will open new paths to the goal of making novel remedies for the prevention of lethal ventricular arrhythmias and sudden cardiac arrest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,930
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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