The HIV-1 accessory proteins Nef and Vpu downregulate total and cell surface CD28 in CD4+ T cells
Notice bibliographique
Résumé
The HIV-1 accessory proteins Nef and Vpu alter cell surface levels of multiple host proteins to modify the immune response and increase viral persistence. Nef and Vpu can downregulate cell surface levels of the co-stimulatory molecule CD28, however the mechanism of this function has not been completely elucidated. Here, we provide evidence that Nef and Vpu decrease cell surface and total cellular levels of CD28. Moreover, using inhibitors we implicate the cellular degradation machinery in the downregulation of CD28. We shed light on the mechanisms of CD28 downregulation by implicating the Nef LL 165 and DD 175 motifs in decreasing cell surface CD28 and Nef DD 175 in decreasing total cellular CD28. Moreover, the Vpu LV 64 and S 52/56 motifs were required for cell surface CD28 downregulation, while, unlike for CD4 downregulation, Vpu W 22 was dispensable. The Vpu S 52/56 motif was also critical for Vpu-mediated decreases in total CD28 protein level. Finally, the ability of Vpu to downregulate CD28 is conserved between multiple group M Vpu proteins and infection with viruses encoding or lacking Nef and Vpu have differential effects on activation upon stimulation. We report that Nef and Vpu downregulate cell surface and total cellular CD28 levels. We identified inhibitors and mutations within Nef and Vpu that disrupt downregulation, shedding light on the mechanisms utilized to downregulate CD28. The conservation and redundancy between the abilities of two HIV-1 proteins to downregulate CD28 highlight the importance of this function, which may contribute to the development of latently infected cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».