MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2783814133 · doi:10.30699/mmlj17.1.2.68

Detection and Distribution of various HLAR Gene in Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium by Multiplex-PCR

2018· article· en· W2783814133 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueModern Medical Laboratory Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiologyEnterococcus faecalisBiologyMultiplex polymerase chain reactionEnterococcusGeneAntibioticsPolymerase chain reactionGeneticsEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In recent years, three new aminoglycoside resistance genes such as aph (3)-IIIa and ant (4)-Ia, that encode for the APH (3) and ANT (4) have also been identified. The aim of this study was to come up with a multiplex-PCR procedure for detection of aac(6)-Ie-aph(2)-Ia, aph(3)-IIIa, ant(4)-Ia genes in the Enterococcus spp. clinical isolates. Material and Method: 100 samples were isolated from various specimens, from various hospitals in Tehran, Iran. The grown colonies were identified by standard biochemical and disc diffusion tests. Multiplex-PCR for aac (6')-Ie -aph(2'')-Ia , aph(3)-IIIa, ant(4)-Ia genes amplification were performed in order to confirm bacterial colonies as Enterococcus spp. Results: Eighty four (84%) Enterococcus spp. isolates were collected from the 100 specimens. The highest and lowest isolates were related to urine (48%) and sputum (2%). Antibiotic susceptibility test results showed that the highest and lowest resistance was related to tetracycline and nitrofurantoin, respectively. Multiplex PCR results revealed that aac (6)-Ie-aph (2)-Ia, ant (4)-Ia and aph (3)-IIIa genes were present in 6% of the isolated bacteria from the urine, 2% from the wound and 1% from the pleural samples. the aac (6)-Ie-aph (2)-Ia and aph (3)-IIIa genes were present in 25% of the isolated strains from the urine, 3% from the wound and 2% from the plural specimens. Nine percent of the strains were isolated from the urine, 3% from the wound and 1% from the plural were positive for aac (6)-Ie-aph (2)-Ia and ant (4)-Ia genes. Discussion: we had observed enterococci isolates with phenotypic resistance to HLAR and demonstrated aac(6)-Ie-aph(2)-Ia and aph(3)-IIIa genes more frequently occurring than other genes. A collection of AMEs are accountable for HLAR status among Enterococcus species. The aac (6)-Ie-aph (2)-Ia gene was detected more frequently than the other genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,336
Score d'incertitude au seuil0,844

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle