Detection and Distribution of various HLAR Gene in Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium by Multiplex-PCR
Notice bibliographique
Résumé
In recent years, three new aminoglycoside resistance genes such as aph (3)-IIIa and ant (4)-Ia, that encode for the APH (3) and ANT (4) have also been identified. The aim of this study was to come up with a multiplex-PCR procedure for detection of aac(6)-Ie-aph(2)-Ia, aph(3)-IIIa, ant(4)-Ia genes in the Enterococcus spp. clinical isolates. Material and Method: 100 samples were isolated from various specimens, from various hospitals in Tehran, Iran. The grown colonies were identified by standard biochemical and disc diffusion tests. Multiplex-PCR for aac (6')-Ie -aph(2'')-Ia , aph(3)-IIIa, ant(4)-Ia genes amplification were performed in order to confirm bacterial colonies as Enterococcus spp. Results: Eighty four (84%) Enterococcus spp. isolates were collected from the 100 specimens. The highest and lowest isolates were related to urine (48%) and sputum (2%). Antibiotic susceptibility test results showed that the highest and lowest resistance was related to tetracycline and nitrofurantoin, respectively. Multiplex PCR results revealed that aac (6)-Ie-aph (2)-Ia, ant (4)-Ia and aph (3)-IIIa genes were present in 6% of the isolated bacteria from the urine, 2% from the wound and 1% from the pleural samples. the aac (6)-Ie-aph (2)-Ia and aph (3)-IIIa genes were present in 25% of the isolated strains from the urine, 3% from the wound and 2% from the plural specimens. Nine percent of the strains were isolated from the urine, 3% from the wound and 1% from the plural were positive for aac (6)-Ie-aph (2)-Ia and ant (4)-Ia genes. Discussion: we had observed enterococci isolates with phenotypic resistance to HLAR and demonstrated aac(6)-Ie-aph(2)-Ia and aph(3)-IIIa genes more frequently occurring than other genes. A collection of AMEs are accountable for HLAR status among Enterococcus species. The aac (6)-Ie-aph (2)-Ia gene was detected more frequently than the other genes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».