Evolutionary GEM: Evolution of Cytochrome c Oxidase IV Regulation in Mammals
Notice bibliographique
Résumé
Aerobic respiration, although metabolically advantageous in O2-rich environments, can be detrimental to the cell when O2 is not fully reduced resulting in cytotoxic reactive oxygen species (ROS) production. Cytochrome c oxidase subunit 4 (COX-4) is primarily responsible for fully reducing O2 during metabolism and exists as COX4-1 and COX4-2 isoforms. The former exists in normoxia, but is replaced by the latter in hypoxia. This change is brought about by two mechanisms, the first involving regulation by hypoxia inducible factor 1 (HIF-1), which directly upregulates COX4-2 and indirectly degrades COX4-1. The second mechanism involves an oxygen responsive element (ORE), which upregulates COX4-2 in a HIF-1 independent manner. The convergence of two unrelated pathways to regulate COX4-1 and COX4-2 would allow cells to optimize their metabolic profile within an environment experiencing varying O2, such as Earth’s early atmosphere in the case of primitive aerobic bacteria or in multicellular organisms where O2 levels vary between tissues such as lung tissue.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».