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Enregistrement W2785318676 · doi:10.1101/238733

CYRI1-mediated inhibition of RAC1 signalling restricts <i>Salmonella</i> Typhimurium infection

2017· preprint· en· W2785318676 sur OpenAlexafffund
Kyoko E. Yuki, Hadir Marei, Evgenij Fiškin, Megan M. Eva, Angelica A. Gopal, Jeremy Schwartzentruber, Jacek Majewski, Mathieu Cellier, Judith N. Mandl, Silvia M. Vidal, Danielle Malo, Ivan Đikić

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche ScientifiqueMcGill UniversityMcGill Genome CentreArmand Frappier MuseumMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéDeutsche ForschungsgemeinschaftCanadian Institutes of Health ResearchEuropean Commission
Mots-clésSalmonellaRAC1EffectorBiologyCell biologyActin cytoskeletonPathogenicity islandActinMicrobiologySignal transductionCytoskeletonCellBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Salmonella presents a global public health concern. Central to Salmonella pathogenicity is an ability to subvert host defence mechanisms through bacterial effectors that target key host proteins implicated in restricting infection. Thus, to gain insight into host-pathogen interactions governing Salmonella infection, a thorough understanding of host defence mechanisms is needed. To tackle this, we performed an in vivo genome-wide ENU mutagenesis screen to uncover novel host defence proteins. Through this screen we identified an uncharacterised protein, which we name CYRI1 ( CY FIP-related R AC1 Interacting protein 1 ) that serves as a Salmonella resistance factor. We show that CYRI1 binds to the small GTPase RAC1 through a conserved domain present in CYFIP proteins, which are known RAC1 effectors that stimulate actin polymerisation. However, unlike CYFIP proteins, CYRI1 negatively regulates RAC1-driven actin cytoskeleton remodelling, thereby attenuating processes such as phagocytosis and cell migration. This, in turn, enables CYRI1 to counteract Salmonella at various stages of infection, including bacterial entry into epithelial cells, internalisation into myeloid-derived phagocytes as well as phagocyte-mediated bacterial dissemination. Together, this outlines a novel host defence mechanism that is crucial for determining bacterial fate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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