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Enregistrement W2786211139 · doi:10.12688/f1000research.13704.1

Zika virus infection as a cause of congenital brain abnormalities and Guillain-Barré syndrome: From systematic review to living systematic review

2018· preprint· en· W2786211139 sur OpenAlexaff
Michel Jacques Counotte, Dianne Egli-Gany, Maurane Riesen, Million Abraha, Teegwendé Valérie Porgo, Jingying Wang, Nicola Low

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésZika virusMicrocephalyMedicineGuillain-Barre syndromeSystematic reviewOutbreakPediatricsIntensive care medicineMeta-analysisDiseaseMEDLINEImmunologyVirusVirologyPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. The Zika virus (ZIKV) outbreak in the Americas has caused international concern due to neurological sequelae linked to the infection, such as microcephaly and Guillain-Barré syndrome (GBS). The World Health Organization stated that there is “sufficient evidence to conclude that Zika virus is a cause of congenital abnormalities and is a trigger of GBS”. This conclusion was based on a systematic review of the evidence published until 30.05.2016. Since then, the body of evidence has grown substantially, leading to this update of that systematic review with new evidence published from 30.05.2016 – 18.01.2017, update 1. Methods. We review evidence on the causal link between ZIKV infection and adverse congenital outcomes and the causal link between ZIKV infection and GBS or immune-mediated thrombocytopaenia purpura. We also describe the transition of the review into a living systematic review, a review that is continually updated. Results. Between 30.05.2016 and 18.01.2017, we identified 2413 publications, of which 101 publications were included. The evidence added in this update confirms the conclusion of a causal association between ZIKV and adverse congenital outcomes. New findings expand the evidence base in the dimensions of biological plausibility, strength of association, animal experiments and specificity. For GBS, the body of evidence has grown during the search period for update 1, but only for dimensions that were already populated in the previous version. There is still a limited understanding of the biological pathways that potentially cause the occurrence of autoimmune disease following ZIKV infection. Conclusions. This systematic review confirms previous conclusions that ZIKV is a cause of congenital abnormalities, including microcephaly, and is a trigger of GBS. The transition to living systematic review techniques and methodology provides a proof of concept for the use of these methods to synthesise evidence about an emerging pathogen such as ZIKV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,056
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,056
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,006
Bibliométrie0,0090,011
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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