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Enregistrement W2789880737 · doi:10.21037/aes.2018.ab040

AB040. Pou2f1/2 are required for the specification of cone photoreceptors in the developing retina

2018· article· en· W2789880737 sur OpenAlexaff
Awais Javed, Pierre Mattar, Michel Cayouette

Notice bibliographique

RevueAnnals of Eye Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCone (formal languages)RetinaOphthalmologyNeuroscienceComputer scienceBiologyMedicineProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Rods and cones are critical for light detection. Although there has been considerable work done in elucidating the molecular mechanisms involved in rod development, not much is known about how the cone cell fate decision is made by the multipotent retinal progenitor cells during development. Analysis of the promoter regions of Nrl and trβ2, rod and cone differentiation factors respectively, revealed DNA binding motifs of two POU-domain containing transcription factors, Pou2f1 and Pou2f2. Preliminary experiments showed that Pou2f1/2 are expressed during the peak of cone genesis in the embryonic retina. Therefore, we hypothesize that Pou2f1/2 specify cone cell fate in the developing retina. Methods: We used immunofluorescence and in situ hybridization to establish the spatiotemporal expression of Pou2f1/2 during retinogenesis. We performed in vivo electroporation in post-natal mice to misexpress Pou2f1/2 and used antibodies specific to proteins expressed in cones such as Rxrγ and S-opsin to count cones. Using ex vivo electroporation of embryonic retinal explants, we knocked out Pou2f1 and Pou2f2 using CRISPR/Cas9 gRNAs at the peak of cone production window. Finally, we transfected post-natal retinal explants with a combination of regulatory elements of Nrl or thrb with control backbone vector, Pou2f1 or Pou2f2 using electroporation. Results: We found that Pou2f1/2 are expressed in retinal progenitor cells in the developing retina and subsequently in the differentiated cones. Pou2f1/2 misexpression outside the cone genesis window led to an increase in cones at the expense of rods. Pou2f1/2 indel knockouts generated by CRISPR/Cas9 gRNAs led to a decrease in cones and a converse increase in rods. Finally, we found that Pou2f1/2 activate the cis-regulatory module (CRM) of the thrb gene and repress the activity of the CRM of Nrl. Conclusions: These results uncover novel players that establish the complex gene regulatory network for cone photoreceptor fate specification in the retinal progenitor cells. We anticipate that this work should help us devise improved replacement therapies in the future utilizing stem cells for retinal degenerative diseases such as aged-related macular degeneration (AMD) and Stargardt’s disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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