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Enregistrement W2790119699 · doi:10.1093/jcag/gwy009.095

A95 INFLAMMATORY PROTEASES DRIVE A MIGRATORY INTESTINAL EPITHELIAL PHENOTYPE THROUGH THE GENERATION OF BIOACTIVE PEPTIDE FRAGMENTS OF E-CADHERIN

2018· article· en· W2790119699 sur OpenAlexaffabout
Marilyn Gordon, Anaïs Chauvin, François‐Michel Boisvert, Wallace K. MacNaughton

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteasesWound healingCell biologyNeutrophil elastaseChemistryBiologyBiochemistryMolecular biologyInflammationImmunologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The inflammatory microenvironment in the gut contains a variety of proteases which are known to be increased in patient samples in both IBD and CRC. How these proteases and their proteolytic peptide products contribute to wound resolution has been poorly elucidated. A cellular switch from a “barrier” to a “migration/repair” phenotype is required for healing in IBD, but is also a hallmark of tumorigenesis. Proteolytic degradation of epithelial E-cadherin (Ecad) is necessary for this process, we have been studying the biological activity small peptide fragments of Ecad generated by neutrophil elastase, an inflammatory protease elevated in IBD. We have been studying the ability of proteases to induce a switch in the colonic epithelium from a barrier to a repair phenotype (epithelial to mesenchymal transition [EMT]) characterized by increased migration and disrupted homeostasis. To test the hypothesis that inflammatory proteases process Ecad into small bioactive peptides that contribute to wound resolution. Recombinant Ecad was incubated with neutrophil elastase (NE) in vitro to produce NE-dependent Ecad peptides. Six of these peptides shared partial homology with Ecad peptides identified by mass spectrometry in IBD patient samples, and were chosen for further characterization. Peptides were synthesized and assayed for their ability to alter wound healing capacity, proliferation, cell spreading, and cytotoxicity in Caco-2 cells using the IncuCyte™ live-cell imaging system for 48 hours following exposure to 1, 10, and 100 mg/mL concentrations of peptides. All analysis was done using the IncuCyte™ ZOOM platform in conjunction with ImageJ software. We have identified 6 Ecad peptides produced by neutrophil elastase activity that appear to be increased in IBD patient tissue. We have characterized these peptides to have novel biological roles in altering wound resolution and proliferation rates, with 3 peptides showing significantly increased wound healing capacity at at least one concentration. These 3 peptides (KAADTDPTAPPYD, NRNTGVISVV, and LPPEDDTRDNV) showed improved wound closures of approximately 7–10% under serum free conditions and 5–10% under full serum conditions compared to controls. Preliminary data also suggests that these peptides appear to have a positive effect on proliferation rates, and appear to alter cellular morphology of cells to that of a more flattened cell type, typical of repair programming of cells to cover a denuded area. Our data reveal a novel role for proteolytic processing of Ecad under inflammatory conditions, producing bioactive peptides that drive a wound-healing phenotype in epithelial cells in response to damage. CIHRUniversity of Calgary Faculty Seed Grants

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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