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Enregistrement W2790694239 · doi:10.1093/jcag/gwy008.246

A245 THE ROLE OF P53 ON P2Y6R EXPRESSION IN COLORECTAL CANCER.

2018· article· en· W2790694239 sur OpenAlexaff
Caroline M. Molle, Guillaume Arguin, Morgane Placet, Fernand‐Pierre Gendron

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMessenger RNAGene isoformColorectal cancerGeneCancer researchMutantGene expressionOncogeneCancerGeneticsCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The G protein-coupled P2Y6 receptor (P2Y6R) is activated by extracellular UDP. In the colonic epithelium, it participates in the maintenance of the hydric balance by regulating NaCl secretion. More recently, P2Y6R activity was reported to worsen inflammatory symptoms in a mouse model of inflammatory bowel diseases (IBD). Long-term IBD-suffering patients are at higher risk of developing colorectal cancer (CRC). In response to chronic exposure to inflammatory stressors, p53 is one of the first mutated oncogene, which leads to colitis-associated CRC. We focused on the potential role of p53 in the regulation of P2Y6R expression in CRC. The hypothesis is that the presence of a mutant form of p53 will differentially regulate P2Y6R expression as compared to the wild-type protein. The general aim of our work is to characterize the molecular mechanisms associated with p53-dependent regulation of P2Y6R in CRC. More specifically, we will 1) determine and characterize the P2RY6 promoter in cancerous intestinal epithelial cells (cIEC) and 2) study the role of wild-type or mutant p53 on P2Y6R expression. The P2RY6 gene encodes for 8 messenger RNA (mRNA) variants. Most of them are encoding for the P2Y6R isoform 1 which is well characterized. However, mRNA variant 9 codes for an uncharacterized form of the receptor: isoform 2. We used 5’RACE experiments to identify the different transcription start sites (TSS) corresponding to the several mRNA variants and determined the amount of each variant in cIECs. We then cloned four consensus regions (R1, R2, R3 and R4) of the P2RY6 promoter encompassing the four previously identified TSS upstream of the luciferase reporter gene in the pGL4.10 vector. The pGL4.10-P2RY6 promoter constructs were cotransfected with wild-type p53 and mutant forms and transcription activity measured by luciferase assays. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays were used to confirm the luciferase results. We identified four TSS in the P2RY6 promoter region and showed that Caco-2 cells expressed predominantly mRNA variant 9. Using luciferase assays, we showed that wild-type p53 can activate the promoter R1 and R4 regions, whereas p53 R273H mutant (p53R273H) has no effect on the transcriptional activity of the R1 region but significantly stimulated the R4 promoter region. The ChIP experiments showed that p53R273H could occupy the R4 but not the R1 region; whereas wild-type p53 could bind both R1 and R4 regions. Finally, AlphaScreen Surefire assays suggest that UDP also activates P2Y6R isoform 2. We showed that wild-type p53 and p53R273H mutant differently regulate P2Y6R expression in cIEC. Hence, p53R273H mutant seems to favor the expression of P2Y6R isoform 2 for which the function is not yet identified but are likely linked to stimulation of cell proliferation and resistance to apoptosis. CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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