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Enregistrement W2791520406 · doi:10.1093/hmg/ddy083

Expression of C9orf72-related dipeptides impairs motor function in a vertebrate model

2018· article· en· W2791520406 sur OpenAlexafffund
Amrutha Swaminathan, Marilou Bouffard, Meijiang Liao, Sarah Ryan, Janis Bennion Callister, Stuart Pickering‐Brown, Gary A.B. Armstrong, Pierre Drapeau

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyC9orf72HaploinsufficiencyGeneticsTrinucleotide repeat expansionAmyotrophic lateral sclerosisZebrafishMotor neuronPhenotypeLoss functionCell biologyGeneNeuroscienceAllelePathologySpinal cord

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Large expansions of hexanucleotide GGGGCC (G4C2) repeats (hundreds to thousands) in the first intron of the chromosome 9 open reading frame 72 (C9orf72) locus are the strongest known genetic factor associated with amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal lobar degeneration. Different hypotheses exist about the underlying disease mechanism including loss of function by haploinsufficiency, toxicity arising as a result of RNA or dipeptide repeats (DPRs). Five different DPRs are produced by repeat-associated non-ATG-initiated translation of the G4C2 repeats. Though earlier studies have indicated toxicity of the DPRs in worms, flies, primary cultured cells and cell lines, the effect of expressing DPRs of amyotrophic lateral sclerosis-relevant length has not been tested on motor behaviour in vertebrate models. In this study, by expressing constructs with alternate codons encoding different lengths of each DPR (40, 200 and 1000) in the vertebrate zebrafish model, the GR DPR was found to lead to the greatest developmental lethality and morphological defects, and GA, the least. However, expressing 1000 repeats of any DPR, including the 'non-toxic' GA DPR led to locomotor defects. Based on these observations, a transgenic line stably expressing 100 GR repeats was generated to allow specific regional and temporal expression of GR repeats in vivo. Expression of GR DPRs ubiquitously resulted in severe morphological defects and reduced swimming. However, when expressed specifically in motor neurons, the developmental defects were significantly reduced, but the swimming phenotype persisted, suggesting that GR DPRs have a toxic effect on motor neuron function. This was validated by the reduction in motor neuron length even in already formed motor neurons when GR was expressed in these. Hence, the expression of C9orf72-associated DPRs can cause significant motor deficits in vertebrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,547
Score d'incertitude au seuil0,551

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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