Functional organization of cytoplasmic portals controlling access to the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) chloride channel pore
Notice bibliographique
Résumé
The cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) is a Cl − channel that apparently has evolved from an ancestral active transporter. Key to the CFTR's switch from pump to channel function may have been the appearance of one or more "lateral portals." Such portals connect the cytoplasm to the transmembrane channel pore, allowing a continuous pathway for the electrodiffusional movement of Cl − ions. However, these portals remain the least well-characterized part of the Cl − transport pathway; even the number of functional portals is uncertain, and if multiple portals do exist, their relative functional contributions are unknown. Here, we used patch-clamp recording to identify the contributions of positively charged amino acid side chains located in CFTR's cytoplasmic transmembrane extensions to portal function. Mutagenesis-mediated neutralization of several charged side chains reduced single-channel Cl − conductance. However, these same mutations differentially affected channel blockade by cytoplasmic suramin and Pt(NO 2 ) 4 2− anions. We considered and tested several models by which the contribution of these positively charged side chains to one or more independent or non-independent portals to the pore could affect Cl − conductance and interactions with blockers. Overall, our results suggest the existence of a single portal that is lined by several positively charged side chains that interact electrostatically with both Cl − and blocking anions. We further propose that mutations at other sites indirectly alter the function of this single portal. Comparison of our functional results with recent structural information on CFTR completes our picture of the overall molecular architecture of the Cl − permeation pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».