Invasive serogroup W Neisseria meningitidis (MenW) in Ontario, Canada shows potential clonal replacement during the period January 1, 2009 – June 30, 2016
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: (MenW) accounts for a small percentage of all invasive meningococcal disease (IMD) and between 2010 and 2014, only zero to three confirmed cases occurred per year. However, between August 2015 and June 2016, six culture confirmed MenW IMD cases were reported in Ontario. OBJECTIVE: strains involved were characterized. METHODS: MenW cases were identified in the Integrated Public Health Information System byf Public Health Ontario. MenW isolates were characterized at the National Microbiology Laboratory. RESULTS: Of the thirteen MenW IMD cases, six were due to isolates typed as sequence type (ST)-22 clonal complex (cc), six were of ST-11 cc, and one ST-167 cc. Most (83%) MenW cases due to the ST-22 cc occurred prior to 2012 while all six MenW cases due to ST-11 cc happened since May 2014. The six MenW ST-11 isolates appeared to be clonal. CONCLUSION: It appears that a genetic shift in the invasive MenW isolates has occurred in Ontario in 2014 with the ST-11 clone replacing the traditional ST-22 clone.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».