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Enregistrement W2792141816 · doi:10.1002/pep2.24051

Lipid membrane interactions of a fluorinated peptide with potential ion channel‐forming ability

2018· article· en· W2792141816 sur OpenAlexafffund
Maud Auger, Thierry Lefèvre, François Otis, Normand Voyer, Michéle Auger

Notice bibliographique

RevuePeptide Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensUniversité LavalPROTEO
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMembranePeptideChemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyMolecular dynamicsSpectroscopyProtein secondary structureBiophysicsCrystallographyComputational chemistryStereochemistryBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fluorinated peptides attract much interest in the biomedical area because they generally exhibit an enhanced stability compared to their hydrogenated counterparts and because fluorine atoms represent efficient probes to investigate peptide assemblies, especially in membranes. We previously designed and characterized a fluorinated peptide intended to form ion channels in membranes. This peptide, designated as LX2, adopts a predominantly α‐helical structure and acts as a selective ion channel for various cations. Molecular dynamics indicated that the peptide tetrameric form would be favored. However, the interactions of LX2 with model membranes have not been studied experimentally. Here we investigated the interactions of LX2 and its acetylated form, Ac‐LX2, with eukaryotic model membranes using CD and infrared spectroscopy, as well as 19F, 2H, and 31P NMR spectroscopy. 19F NMR results indicate that the peptides undergo restrained motions in the presence of membranes, which strongly suggests their insertion in membranes. Both LX2 and Ac‐LX2 adopt a well‐defined α‐helical structure, in contrast with the secondary structure observed in hexafluoroisopropanol. The alterations of lipid organization due to LX2 peptides appear overall relatively small but the results suggest that the two peptides are located in the membrane hydrophobic core, LX2 being closer to the interfacial region than Ac‐LX2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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