Lipid membrane interactions of a fluorinated peptide with potential ion channel‐forming ability
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Fluorinated peptides attract much interest in the biomedical area because they generally exhibit an enhanced stability compared to their hydrogenated counterparts and because fluorine atoms represent efficient probes to investigate peptide assemblies, especially in membranes. We previously designed and characterized a fluorinated peptide intended to form ion channels in membranes. This peptide, designated as LX2, adopts a predominantly α‐helical structure and acts as a selective ion channel for various cations. Molecular dynamics indicated that the peptide tetrameric form would be favored. However, the interactions of LX2 with model membranes have not been studied experimentally. Here we investigated the interactions of LX2 and its acetylated form, Ac‐LX2, with eukaryotic model membranes using CD and infrared spectroscopy, as well as 19F, 2H, and 31P NMR spectroscopy. 19F NMR results indicate that the peptides undergo restrained motions in the presence of membranes, which strongly suggests their insertion in membranes. Both LX2 and Ac‐LX2 adopt a well‐defined α‐helical structure, in contrast with the secondary structure observed in hexafluoroisopropanol. The alterations of lipid organization due to LX2 peptides appear overall relatively small but the results suggest that the two peptides are located in the membrane hydrophobic core, LX2 being closer to the interfacial region than Ac‐LX2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».