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Enregistrement W2792254088 · doi:10.1093/jcag/gwy008.155

A154 PROPERDIN DEFICIENCY DOES NOT IMPACT THE MOUSE RESPONSE TO DSS-INDUCED COLITIS DESPITE DIFFERENCES IN COLONIC MICROBIOME

2018· article· en· W2792254088 sur OpenAlexafffund
Andrew W. Stadnyk, Gavin M. Douglas, A. Comeau, Umang Jain, Wilhelm Schwaeble, Cordula Stover, R Bieko, Morgan G. I. Langille

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNova Scotia Health Research Foundation
Mots-clésColitisMicrobiomeProperdinImmunologyFecesBiologyMicrobiologyDysbiosisComplement systemMedicineImmune systemBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of complement in colitis is only beginning to be understood. We reported that properdin deficient mice (PKO) have increased susceptibility to infectious colitis and to piroxicam-provoked colitis when combined with IL-10 deficiency. Here we examined the PKO strain’s response to chemical colitis, including their colon microbiome. The aim was to determine whether properdin deficiency impacted the intestinal microbiome and response to DSS. Second generation offspring from PKO X C57BL/6 wildtype (WT) matings were used. Dextran sulfate sodium (DSS) was added to their water for 5 days, then groups of mice were killed either 1 (acute) or up to 5 days (recovery) later. The animals’ weights were recorded and stool collected and frozen. At necropsy their colons were extracted, measured, a scraping collected, and the remainder prepared for histology or cultured overnight for secreted mediators. DNA was isolated from stool and mucosal scrapes and the 16S rRNA gene was amplified and sequenced for microbiome analysis. All mice lost weight and became inflamed with no significant difference between strains in any measure of pathology or anaphylatoxin levels. This was despite a significant difference in the colon microbiome of healthy mice of the two strains, and the colitis resulting in significant changes in the microbiome of both strains. Interestingly, a greater change was detected in mucosal scrapes but not feces of WT compared to PKO mice. We conclude that properdin does not play a role in chemical-induced colitis despite the mice hosting a different microbiome. Moreover, our results underscore how models of colitis may have different mechanisms including the relationship between complement and the microbiome. Nova Scotia Health Research Foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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