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Enregistrement W2793031031 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-18-1740

USP7 Cooperates with NOTCH1 to Drive the Oncogenic Transcriptional Program in T-Cell Leukemia

2018· article· en· W2793031031 sur OpenAlexfundno aff
Carlos A. Martínez, Kelly M. Arcipowski, Yixing Zhu, Blanca T. Gutierrez-Diaz, Kenneth K. Wang, Megan R. Johnson, Andrew Volk, Feng Wang, Jian Wu, Charles Grove, Hui Wang, Ivan Sokirniy, Paul M. Thomas, Young Ah Goo, Nebiyu Abshiru, Nobuko Hijiya, Sofie Peirs, Niels Vandamme, Geert Berx, Steven Goosens, Stacy A. Marshall, Emily J. Rendleman, Yoh-hei Takahashi, Lu Wang, Radhika Rawat, Elizabeth T. Bartom, Clayton K. Collings, Pieter Van Vlierberghe, Alexandros Strikoudis, Stephen Kelly, Beatrix Ueberheide, Christine Mantis, Irawati Kandela, Jean‐Pierre Bourquin, Beat Bornhäuser, Valentina Serafin, Silvia Bresolin, Maddalena Paganin, Benedetta Accordi, Giuseppe Basso, Neil L. Kelleher, Joseph Weinstock, Suresh Kumar, John D. Crispino, Ali Shilatifard, Panagiotis Ntziachristos

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroYork UniversityEuropean Hematology AssociationNorthwestern University
Mots-clésDemethylaseDeubiquitinating enzymeBiologyCancer researchLeukemiaChromatinDruggabilityCell growthTranscription factorEpigeneticsGeneUbiquitinGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose: T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is an aggressive disease, affecting children and adults. Chemotherapy treatments show high response rates but have debilitating effects and carry risk of relapse. Previous work implicated NOTCH1 and other oncogenes. However, direct inhibition of these pathways affects healthy tissues and cancer alike. Our goal in this work has been to identify enzymes active in T-ALL whose activity could be targeted for therapeutic purposes. Experimental Design: To identify and characterize new NOTCH1 druggable partners in T-ALL, we coupled studies of the NOTCH1 interactome to expression analysis and a series of functional analyses in cell lines, patient samples, and xenograft models. Results: We demonstrate that ubiquitin-specific protease 7 (USP7) interacts with NOTCH1 and controls leukemia growth by stabilizing the levels of NOTCH1 and JMJD3 histone demethylase. USP7 is highly expressed in T-ALL and is transcriptionally regulated by NOTCH1. In turn, USP7 controls NOTCH1 levels through deubiquitination. USP7 binds oncogenic targets and controls gene expression through stabilization of NOTCH1 and JMJD3 and ultimately H3K27me3 changes. We also show that USP7 and NOTCH1 bind T-ALL superenhancers, and inhibition of USP7 leads to a decrease of the transcriptional levels of NOTCH1 targets and significantly blocks T-ALL cell growth in vitro and in vivo. Conclusions: These results provide a new model for USP7 deubiquitinase activity through recruitment to oncogenic chromatin loci and regulation of both oncogenic transcription factors and chromatin marks to promote leukemia. Our studies also show that targeting USP7 inhibition could be a therapeutic strategy in aggressive leukemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,562
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,126
Tête enseignante GPT0,468
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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