Increase in Neisseria meningitidis serogroup W invasive disease in Canada: 2009–2016
Notice bibliographique
Résumé
Background: Since 2010, there has been an increase in serogroup W Neisseria meningitidis (MenW) disease in many countries due to an emerging sequence type-11 clonal complex (ST-11 CC).In 2016, a small increase in MenW disease due to the ST-11 CC was documented in Ontario, Canada.Objective: To examine the trends in MenW disease in Canada and to assess whether there have been changes in the type of ST clonal complex causing MenW disease between 2009-2016.Methods: Invasive N. meningitidis isolates routinely submitted from across the country to the National Microbiology Laboratory were analyzed.The proportional distribution of MenW compared with other serogroups was calculated.The MenW isolates were then further characterized by serotype, serosubtype and ST clonal complex.The geographic distribution of the emerging ST-11 CC was documented and the age of patients with ST-11 CC was compared with the traditional ST-22 CC.Results: Of the 888 invasive isolates examined, 63 were MenW giving an average annual rate of 7.1%.However, the percentage of MenW varied from 2.7% in 2012 to 18.8% in 2016.From 2009 to 2013, 91% of the MenW were typed as the traditional ST-22 CC while from 2014 to 2016, 75% were typed to be the emerging ST-11 CC.ST-11 MenW CC was documented in five provinces across Canada (British Columbia, Alberta, Manitoba, Ontario and Quebec).The median age of patients infected with the emerging ST-11 MenW CC was 53.5 years, while for patients with the traditional ST-22 CC it was 23.5 years.Conclusion: MenW meningococcal disease is growing in prevalence in Canada and is associated with an increase in the emerging ST-11 CC.This emerging clonal complex has now been identified in five provinces in Canada.It appears to be more common in older patients than the traditional ST-22 CC, which occurs more often in younger patients.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».