An RNA‐Cleaving Catalytic DNA Accelerated by Freezing
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The EtNa DNAzyme was isolated during the isopropanol precipitation step of an in vitro selection effort. Although inactive with the intended cofactor, its RNA cleavage activity was observed under a few conditions. With Na + , EtNa was highly active in ∼50 % ethanol, whereas in water, it was highly active with Ca 2+ . In this work, we showed that the EtNa DNAzyme was accelerated by freezing in water in the presence of Na + . The apparent K d value reached 6.2 m m Na + under the frozen condition, over 20 times tighter than that in water at room temperature. With 10 m m Na + , EtNa had a cleavage rate of 0.12 h −1 after freezing at −20 °C. This effect was unique to EtNa, as all other tested DNAzymes were inhibited by freezing except for the Na + ‐specific NaA43. Freezing also inhibited EtNa if Ca 2+ was used. We attributed this to the concentrations of EtNa and Na + in the micropockets between ice crystals, but divalent metals might misfold DNA. Overall, we have systematically studied the effect of freezing on the RNA‐cleavage activity of DNAzymes. The DNAzyme sequence and the metal ion species are both crucial to determine the effect of freezing.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».