MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2793932483 · doi:10.1128/aac.02519-17

Enhanced Ex Vivo Plasmodium vivax Intraerythrocytic Enrichment and Maturation for Rapid and Sensitive Parasite Growth Assays

2018· article· en· W2793932483 sur OpenAlexfundno aff
Gabriel W. Rangel, Martha A. Clark, Usheer Kanjee, Caeul Lim, Kathryn Shaw‐Saliba, Maria José Menezes, Anjali Mascarenhas, Laura Chery, Edwin Gomes, Pradipsinh K. Rathod, Marcelo U. Ferreira, Manoj T. Duraisingh

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoGovernment of CanadaNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoBill and Melinda Gates FoundationHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésEx vivoPlasmodium vivaxParasite hostingBiologyIn vivoPlasmodium (life cycle)MalariaPlasmodium falciparumMicrobiologyApicomplexaVirologyImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Plasmodium vivax chloroquine resistance has been documented in nearly every region where this malaria-causing parasite is endemic. Unfortunately, P. vivax resistance surveillance and drug discovery are challenging due to the low parasitemias of patient isolates and poor parasite survival through ex vivo maturation that reduce the sensitivity and scalability of current P. vivax antimalarial assays. Using cryopreserved patient isolates from Brazil and fresh patient isolates from India, we established a robust enrichment method for P. vivax parasites. We next performed a medium screen for formulations that enhance ex vivo survival. Finally, we optimized an isotopic metabolic labeling assay for measuring P. vivax maturation and its sensitivity to antimalarials. A KCl Percoll density gradient enrichment method increased parasitemias from small-volume ex vivo isolates by an average of >40-fold. The use of Iscove's modified Dulbecco's medium for P. vivax ex vivo culture approximately doubled the parasite survival through maturation. Coupling these with [ 3 H]hypoxanthine metabolic labeling permitted sensitive and robust measurements of parasite maturation, which was used to measure the sensitivities of Brazilian P. vivax isolates to chloroquine and several novel antimalarials. These techniques can be applied to rapidly and robustly assess the P. vivax isolate sensitivities to antimalarials for resistance surveillance and drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,583

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAntimicrobial Agents and ChemotherapyMême sujetMalaria Research and ControlTravaux en français237 207