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Enregistrement W2793991061 · doi:10.1093/jcag/gwy009.091

A91 T CELL-SPECIFIC DELETION OF NOD2 DOES NOT INFLUENCE MICROBIAL RESILIENCE FOLLOWING ANTIBIOTIC EXPOSURE OR MUCOSAL DAMAGE

2018· article· en· W2793991061 sur OpenAlexaffabout
K. Wayne Marshall, Ashleigh Goethel, Kenneth Croitoru

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNOD2DysbiosisBacteroidesImmune systemGut floraBiologyAntibioticsLactobacillus reuteriMicrobiologyImmunologyFirmicutesMicrobiomeLactobacillusClostridiaInnate immune systemBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cause of inflammatory bowel disease (IBD) involves interactions between host genetics, the environment and the gut microbiota. Environmental perturbations, such as antibiotics, induce transient shifts in the microbiota, which may alter T cell-mediated immune responses. We previously found that Nod2 knockout mice show a delayed microbial recovery following antibiotic treatment, and that this altered microbiota influenced the response to T-cell induced mucosal damage in the small intestine. We sought to determine if deletion of Nod2 specifically in CD4+ T cells would play a role in antibiotic induced dysbiosis and resilience of the microbiota and whether this could lead to an altered immune response. Adult Nod2Flox and Nod2ΔCD4 mice received either control or amoxicillin [200 mg/L] ad libitum for one week, followed by control water for four weeks. Stool samples were collected weekly to monitor changes in the gut microbial community. On day 35, small intestinal mucosal damage was induced by an intraperitoneal injection of 50μg anti-CD3. On day 0, the gut microbiota of Nod2Flox and Nod2ΔCD4 littermates did not differ. Antibiotic treatment induced a reduction in the abundance of Firmicutes, including Lactobacillus and Clostridia, whereas Gamma-Proteobacteria and Bacteroidaceae increased compared to water-treated controls on day 7. Anti-CD3 injection induced mucosal damage resulting in increased levels of IFNγ and IL-17 in the small intestine, however there were no differences between genotypes or treatments. Myeloperoxidase, a measure of neutrophil activity, was significantly increased in Nod2Flox mice as compared to Nod2ΔCD4 littermates; however, this difference was ablated if the mice had previously received antibiotics. Our data indicates that while Nod2 is involved in microbial resilience and small intestinal mucosal damage, specific deletion of Nod2 in T cells does not recapitulate the phenotype. Together, this suggests that other (non-CD4+ T) cells are involved in the response to antibiotic-induced perturbations of the gut microbiota. Furthermore, altered microbial composition can influence neutrophil activity during mucosal damage in the small intestine. Department of Immunology, University of Toronto

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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