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Enregistrement W2794137948 · doi:10.1093/jcag/gwy008.165

A164 RAPID INTRAHEPATIC AND PERIPHERAL BLOOD HCV RNA DECLINE AND HCV-SPECIFIC IMMUNE RESPONSE INCREASE DURING IFN-FREE DAA THERAPY IN HCV TREATMENT-NAÏVE PATIENTS

2018· article· en· W2794137948 sur OpenAlexaff
Sonya A. MacParland, Vera Cherepanov, Leen Vijgen, Mohamed Gamil, Maria Beumont, Soocheol Yoon, Ashrafur Rahman, Camelia Capraru, Mario Ostrowski, Mayur Brahmania, David Wong, Richard Harrigan, Harry L.A. Janssen, Mark Sulkowski, Jordan J. Feld

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensToronto Liver CentreMount Sinai HospitalUniversity of British ColumbiaUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésELISPOTPeripheral blood mononuclear cellMedicineHepatitis C virusVirologyImmune systemHepatitis CImmunologyNS3CD8BiologyVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interferon (IFN)-free HCV direct-acting antiviral (DAA) treatment regimens lead to rapid HCV RNA decline and high rates of sustained virologic response (SVR). This study examined the impact of IFN-free DAA treatment on HCV-specific T cell responses and immunophenotypic effects in peripheral blood and in the liver of patients. Nine treatment-naïve patients with HCV genotype 1 and fibrosis stage 0–2 (defined by FibroSure ≤0.48 and APRI score ≤1) were treated for 6 weeks with sofosbuvir (nucleotide polymerase inhibitor), simeprevir (NS3/4A protease inhibitor) and daclatasvir (NS5A inhibitor). Peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and fine needle aspiration liver biopsies (FNAB) were collected at baseline, day 2, week 1, end of treatment (EOT) and post-treatment follow-up week 24. HCV RNA was quantitatively measured at all time points in plasma using the Roche Cobas Taqman HCV assay v2.0 (lower limit of quantification [LLOQ]=15 IU/mL) and in blood and liver samples using the Abbott RealTime HCV assay (LLOQ=12 IU/mL). HCV-specific immune responses were evaluated by Enzyme-Linked ImmunoSpot (ELISPOT) assay with pools of overlapping peptides spanning the HCV genome. Cell quantities available from FNAB samples for assessment of HCV-specific T cell responses were low. PBMC and intrahepatic T cell phenotype and exhaustion were evaluated by flow cytometry with markers for CD3, CD4, CD8, CD127, Tim-3 and PD-1. Plasma HCV RNA rapidly declined and was <15 IU/mL undetectable in all 9 patients at EOT. All 9 patients achieved SVR12 and SVR24. HCV RNA also declined in liver tissue but was still detected in all 9 patients at EOT (low-level detectable in all 9 patients,

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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