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Enregistrement W2794820515 · doi:10.1038/s42003-018-0013-y

Potential for re-emergence of wheat stem rust in the United Kingdom

2018· article· en· W2794820515 sur OpenAlexfundno aff
Clare M. Lewis, Antoine Persoons, Daniel P. Bebber, Rose N. Kigathi, Jens Maintz, Kim Findlay, Vanessa Bueno-Sancho, Pilar Corredor‐Moreno, Sophie A. Harrington, Ngonidzashe Kangara, Anna Berlin, Richard L. Garcia, Silvia Germán, Alena Hanzalová, David Hodson, Mogens S. Hovmøller, Julio Huerta‐Espino, Muhammed Imtiaz, Javed Iqbal Mirza, Annemarie Fejer Justesen, R.E. Niks, Ali Omrani, Mehran Patpour, Z. A. Pretorius, Râmin Roohparvar, Hanan Sela, Ravi P. Singh, Brian J. Steffenson, Botma Visser, Paul Fenwick, Jane Thomas, Brande B. H. Wulff, Diane G. O. Saunders

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBioenergy crop production and management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilAgriculture and Agri-Food CanadaHorizon 2020 Framework ProgrammeJohn Innes FoundationDirectorate for Biological SciencesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésStem rustKingdomRust (programming language)AgronomyBiologyBotanyComputer scienceResistance (ecology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Wheat stem rust, a devastating disease of wheat and barley caused by the fungal pathogen Puccinia graminis f. sp. tritici , was largely eradicated in Western Europe during the mid-to-late twentieth century. However, isolated outbreaks have occurred in recent years. Here we investigate whether a lack of resistance in modern European varieties, increased presence of its alternate host barberry and changes in climatic conditions could be facilitating its resurgence. We report the first wheat stem rust occurrence in the United Kingdom in nearly 60 years, with only 20% of UK wheat varieties resistant to this strain. Climate changes over the past 25 years also suggest increasingly conducive conditions for infection. Furthermore, we document the first occurrence in decades of P. graminis on barberry in the UK . Our data illustrate that wheat stem rust does occur in the UK and, when climatic conditions are conducive, could severely harm wheat and barley production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,167

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,131
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations140
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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