Regulation of ATR activity by the RNA polymerase II phosphatase PNUTS-PP1
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Ataxia telangiectasia mutated and Rad3-related (ATR) kinase is a key factor activated by DNA damage and replication stress. Here, we show that ATR signaling is increased in human cells after depletion of the RNAPII phosphatase PNUTS-PP1, which dephosphorylates RNAPII on Ser 5 of its carboxy-terminal domain (CTD) (pRNAPII S5). Increased ATR signaling was observed in the presence and absence of ionizing radiation or replication stress and even in G1 phase after depletion of PNUTS. Vice versa, ATR signaling was reduced, in a PNUTS dependent manner, after inhibition of the CDK7 kinase mediating pRNAPII S5. Furthermore, CDC73, a well-known RNAPII-CTD binding protein, was required for the high ATR signaling after depletion of PNUTS and co-immunoprecipitated with RNAPII and ATR. These results suggest a novel pathway involving RNAPII, PNUTS-PP1 and CDC73 in ATR signaling and give new insight into the diverse functions of ATR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».