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Enregistrement W2794992214 · doi:10.1101/270066

Tandem tyrosine residues in the EPEC multicargo chaperone CesT support differential type III effector translocation and early host colonization

2018· preprint· en· W2794992214 sur OpenAlexafffund
Cameron S. Runte, Umang Jain, Landon J. Getz, Sabrina Secord, Asaomi Kuwae, Akio Abe, Jason J. LeBlanc, Andrew W. Stadnyk, James B. Kaper, Anne‐Marie Hansen, Nikhil A. Thomas

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesDalhousie UniversityDalhousie Medical Research Foundation
Mots-clésEffectorChaperone (clinical)TyrosineBiologySecretionEnteropathogenic Escherichia coliType three secretion systemCell biologyMicrobiologyChemistryEscherichia coliGeneticsBiochemistryMutantGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) are worldwide human enteric pathogens inflicting significant morbidity and causing large economic losses. A type 3 secretion system (T3SS) is critical for EPEC intestinal colonization, and injection of effectors into host cells contributes to cellular subversion and innate immune evasion. Here, we demonstrate that two strictly conserved C-terminal tyrosine residues, Y152 and Y153, within the multicargo T3SS chaperone CesT serve differential roles in regulating effector secretion in EPEC. Conservative substitution of both tyrosine residues to phenylalanine attenuated EPEC type 3 effector injection into host cells, and significantly limited Tir effector mediated intimate adherence, a key feature of attaching and effacing pathogenesis. Whereas CesT Y153 supported normal levels of Tir translocation, CesT Y152 was strictly required for the effector NleA to be expressed and subsequently translocated into host cells during infection. Other effectors were observed to be dependent on CesT Y152 for maximal translocation efficiency. Unexpectedly, EPEC expressing a CesT Y152, Y153F variant exhibited significantly enhanced effector translocation of many CesT-interacting effectors, further implicating Y152 in CesT functionality. A mouse infection model of EPEC intestinal disease using Citrobacter rodentium revealed that CesT tyrosine substitution variants displayed delayed colonization and were more rapidly cleared from the intestine. These data demonstrate genetically separable functions for strictly conserved tandem tyrosine residues within CesT. Tyrosine 152 of CesT is implicated in NleA expression, providing functional relevance for localized amino acid conservation. Therefore, CesT via its novel C-terminal domain, has relevant roles beyond typical T3SC that interact and stabilize effector proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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