F195. ENRICHMENT OF PATHOGENIC VARIANTS ASSOCIATED WITH TREATABLE GENETIC DISEASES IN LARGE SCHIZOPHRENIA, BIPOLAR AND DEPRESSION COHORTS
Notice bibliographique
Résumé
Genetic diseases are individually rare but collectively common. Many genetic conditions can mimic mental health disorders, with psychiatric symptoms that are difficult to treat with regular medications. Treatment of the underlying genetic disease can cure the associated psychiatric symptoms or help regular medications work better. Discovery of rare genetic diseases in psychiatric patients would reveal specific treatment options, and give information about the chances of other family members being affected. In this study, we test the hypothesis that psychiatric populations are enriched for pathogenic variants associated with selected treatable inborn errors of metabolism (IEMs). Using targeted next-generation sequencing, we screened schizophrenia (n=1132), bipolar (n=719) and major depressive disorder (n=195) patients for variants in genes associated with Niemann-Pick disease type C (NPC), Wilson disease (WD), homocystinuria (HOM) and acute intermittent porphyria (AIP), and compared the frequency of known and predicted pathogenic variants found to 123 136 samples from the gnomAD consortium. Our study is the first to explore the prevalence of NPC, WD, HOM and AIP gene variants in well-defined psychiatric cohorts. Among 2046 cases (male, n=1106; female, n=940), carrier rates of 0·93%, 0·98% and 0·20% for NPC, WD and HOM were seen, respectively. The carrier rate for NPC was marginally enriched in the SCZ cohort (1·15%) compared to general (95% CI, 0·007 – 0·021; p=0·084) and comparison (95% CI, 1·967 – 5·272; p=5·16e-05) populations. AIP affected rate of 0·29% was observed across the entire psychiatric cohort relative to the general (95% CI, 0·001 – 0·006; p=3·47e-13) and comparison (95% CI, 1·572 – 10·044; p=0·012) populations, an almost 300x enrichment in comparison to what is expected in the general population. An enrichment of known and predicted pathogenic variants associated with NPC and AIP was found in the psychiatric cohort, especially in SCZ patients. The results of this proof-of-principle study support that rare genetic disease variants, such as those associated with treatable IEMs, may contribute to the pathogenesis and treatment responsiveness of psychiatric disorders. Discovering genetic diseases in psychiatric patients will shift how health care is delivered to these vulnerable patients by addressing underlying conditions rather than masking symptoms with medications, and has the potential to especially help patients who don’t respond to regular psychotropic medications. Further studies screening large psychiatric cohorts for pathogenic variants in a large panel of treatable IEM genes will reveal the full impact of such disorders for psychiatric patients.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».