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Enregistrement W2795519921 · doi:10.11159/awspt18.119

Assessing the Gene Expression Changes in Oxidative Stress InducedBy BDE-99

2018· article· en· W2795519921 sur OpenAlexvenueno aff
Ayşegül Çerkezkayabekir, Elvan Bakar, Deniz Aksoy

Notice bibliographique

RevueProceedings of the World Congress on Civil, Structural, and Environmental Engineering · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOxidative stressGene expressionStress (linguistics)Oxidative phosphorylationCell biologyGeneChemistryBiophysicsBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

2,2,4,4,5-Pentabromo diphenyl ether (BDE-99), one of the polybrominated diphenyl ethers (PBDE) species are a commercially available chemical substance used as a flame retardant on a large scale.The use of BDE-99 on such a large scale provides further investigation of its effects on live mechanism due to this pollutant may be exposed to seafood, air, water, household wastes and household dust, as well as the most important exposure route is nutrition.Therefore we aim to investigate the gene expression changes of apoptotic and acute oxidative enzyme induced by BDE-99 in rat liver by qRT-PCR.Wistar albino rats, 250-300 g, were randomly divided into one control and two experimental groups (n=8 for each).0,05 mg/kg (dose I) and 0,1 mg/kg (dose II) BDE-99 (in corn oil) were administrated by gavage.10 µm thick sections of paraffin embedded liver tissue samples from harvested after ten days were used for total RNA isolation.The High Pure FFPET RNA Isolation Kit was used following the manufacturer's recommendations.Complementary DNA (cDNA) generated from extracted RNA samples using High-Capacity cDNA Reverse Transcription kit and random primers according to the kit protocol and 2µL of the reverse transcription reaction was subjected to Quantitative real-time PCR (qRT-PCR) amplification as a template.The cycling program consisted of an initial denaturation at 95°C for 10 min, followed by 50 cycles of 95°C for 15 s, 60°C for 1 min, 60°C for 1 min for all genes.Expression quantities of target genes were normalized using GAPDH as an internal gene.Changes in relative expression levels between control and experimental groups were evaluated for statistical significance according to Student-t test.The results were considered statistically significant in p<0.05.SOD expression levels increased significantly in dose I (2,2 fold) and II (2,91 fold) exposure groups but CAT and GSH levels only increased in dose II (1,9 and 2,08 fold respectively).Changes in SOD, CAT and GSH levels indicate that oxidative stress is induced by BDE-99.mRNA levels of HSP70 (2,08 and 6,04 fold), 34 and 20,28), Lamin (1,85 and 5,03 fold) were induced but NuMA levels remained in dose I and II.The increase in HSP70 level, an indicator of cellular stress, also parallels with oxidative stress parameters.Apaf-1 expression level was only increased in dose I (2,54 fold).The changes in expressions of Cas-9 and Apaf-I are also might consider as an evidence of BDE-99-induced cell apoptosis.Besides, it was determined that liver cells responded against nuclear stress by increasing lamin expression.In conclusion, we suggested that BDE-99 cause oxidative stress which leads to cellular apoptosis via increasing the expression levels of apoptotic genes in liver in rat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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