Assessing the Gene Expression Changes in Oxidative Stress InducedBy BDE-99
Notice bibliographique
Résumé
2,2,4,4,5-Pentabromo diphenyl ether (BDE-99), one of the polybrominated diphenyl ethers (PBDE) species are a commercially available chemical substance used as a flame retardant on a large scale.The use of BDE-99 on such a large scale provides further investigation of its effects on live mechanism due to this pollutant may be exposed to seafood, air, water, household wastes and household dust, as well as the most important exposure route is nutrition.Therefore we aim to investigate the gene expression changes of apoptotic and acute oxidative enzyme induced by BDE-99 in rat liver by qRT-PCR.Wistar albino rats, 250-300 g, were randomly divided into one control and two experimental groups (n=8 for each).0,05 mg/kg (dose I) and 0,1 mg/kg (dose II) BDE-99 (in corn oil) were administrated by gavage.10 µm thick sections of paraffin embedded liver tissue samples from harvested after ten days were used for total RNA isolation.The High Pure FFPET RNA Isolation Kit was used following the manufacturer's recommendations.Complementary DNA (cDNA) generated from extracted RNA samples using High-Capacity cDNA Reverse Transcription kit and random primers according to the kit protocol and 2µL of the reverse transcription reaction was subjected to Quantitative real-time PCR (qRT-PCR) amplification as a template.The cycling program consisted of an initial denaturation at 95°C for 10 min, followed by 50 cycles of 95°C for 15 s, 60°C for 1 min, 60°C for 1 min for all genes.Expression quantities of target genes were normalized using GAPDH as an internal gene.Changes in relative expression levels between control and experimental groups were evaluated for statistical significance according to Student-t test.The results were considered statistically significant in p<0.05.SOD expression levels increased significantly in dose I (2,2 fold) and II (2,91 fold) exposure groups but CAT and GSH levels only increased in dose II (1,9 and 2,08 fold respectively).Changes in SOD, CAT and GSH levels indicate that oxidative stress is induced by BDE-99.mRNA levels of HSP70 (2,08 and 6,04 fold), 34 and 20,28), Lamin (1,85 and 5,03 fold) were induced but NuMA levels remained in dose I and II.The increase in HSP70 level, an indicator of cellular stress, also parallels with oxidative stress parameters.Apaf-1 expression level was only increased in dose I (2,54 fold).The changes in expressions of Cas-9 and Apaf-I are also might consider as an evidence of BDE-99-induced cell apoptosis.Besides, it was determined that liver cells responded against nuclear stress by increasing lamin expression.In conclusion, we suggested that BDE-99 cause oxidative stress which leads to cellular apoptosis via increasing the expression levels of apoptotic genes in liver in rat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».