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Enregistrement W2796142615 · doi:10.1002/acn3.560

Progranulin levels in blood in Alzheimer's disease and mild cognitive impairment

2018· article· en· W2796142615 sur OpenAlexfundno aff
Yonatan A. Cooper, Daniel Nachun, Deepika Dokuru, Zhongan Yang, Anna M. Karydas, Ginette Serrero, Binbin Yue, Adam L. Boxer, Bruce L. Miller, Giovanni Coppola

Notice bibliographique

RevueAnnals of Clinical and Translational Neurology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCommon FundNIH Office of the DirectorNational Human Genome Research InstituteNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Mental HealthCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechNational Institute of Neurological Disorders and StrokeIXICOH. Lundbeck A/SNational Cancer InstituteServierEisaiAlzheimer's Foundation of AmericaNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheAlzheimer's Disease Research FoundationUniversity of Southern CaliforniaEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNational Heart, Lung, and Blood InstituteNovartis Pharmaceuticals CorporationBristol-Myers SquibbNational Institute on AgingAlzheimer's Association
Mots-clésMedicineSingle-nucleotide polymorphismMethylationSNPDNA methylationOncologyInternal medicineAlzheimer's diseaseApolipoprotein EWhole bloodDementiaDiseaseGeneGene expressionBiologyGeneticsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective Changes in progranulin ( GRN ) expression have been hypothesized to alter risk for Alzheimer's disease ( AD ). We investigated the relationship between GRN expression in peripheral blood and clinical diagnosis of AD and mild cognitive impairment ( MCI ). Methods Peripheral blood progranulin gene expression was measured, using microarrays from Alzheimer's ( n = 186), MCI ( n = 118), and control ( n = 204) subjects from the University of California San Francisco Memory and Aging Center ( UCSF ‐ MAC ) and two independent published series (AddNeuroMed and ADNI ). GRN gene expression was correlated with clinical, demographic, and genetic data, including APOE haplotype and the GRN rs5848 single‐nucleotide polymorphism. Finally, we assessed progranulin protein levels, using enzyme‐linked immunosorbent assay, and methylation status using methylation microarrays. Results We observed an increase in blood progranulin gene expression and a decrease in GRN promoter methylation in males ( P = 0.007). Progranulin expression was 13% higher in AD and MCI patients compared with controls in the UCSF ‐ MAC cohort ( F 2,505 = 10.41, P = 3.72*10 −5 ). This finding was replicated in the AddNeuroMed ( F 2,271 = 17.9, P = 4.83*10 −8 ) but not the ADNI series. The rs5848 SNP (T‐allele) predicted decreased blood progranulin gene expression ( P = 0.03). The APOE 4 haplotype was positively associated with progranulin expression independent of diagnosis ( P = 0.04). Finally, we did not identify differences in plasma progranulin protein levels or gene methylation between diagnostic categories. Interpretation Progranulin mRNA is elevated in peripheral blood of patients with AD and MCI and its expression is associated with numerous genetic and demographic factors. These data suggest a role in the pathogenesis of neurodegenerative dementias besides frontotemporal dementia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,284

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,238
Tête enseignante GPT0,463
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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