MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2796430964 · doi:10.1111/pai.12903

Atopic dermatitis: Interaction between genetic variants of <i><scp>GSTP</scp>1</i>,<i><scp>TNF</scp></i>,<i><scp>TLR</scp>2</i>, and <i><scp>TLR</scp>4</i> and air pollution in early life

2018· article· en· W2796430964 sur OpenAlexafffund
Anke Hüls, Claudia Klümper, Elaina MacIntyre, Michael Bräuer, Erik Melén, Mario Bauer, Dietrich Berdel, Anna Bergström, Bert Brunekreef, Moira Chan‐Yeung, Elaine Fuertes, Ulrike Gehring, Anna Gref, Joachim Heinrich, Marie Standl, Irina Lehmann, Marjan Kerkhof, Gerard H. Koppelman, Anita L. Kozyrskyj, Göran Pershagen, Christopher Carlsten, Ursula Krämer, Tamara Schikowski

Notice bibliographique

RevuePediatric Allergy and Immunology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDermatology and Skin Diseases
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of British ColumbiaPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesStiftelsen Frimurare Barnhuset i StockholmVetenskapsrådetNaturvårdsverketCanadian Institutes of Health ResearchStockholms Läns LandstingHjärt-LungfondenNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekSvenska Sällskapet för Medicinsk ForskningSvenska Forskningsrådet FormasZonMw
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismMedicineAtopic dermatitisImmunologySNPOxidative stressAlleleInflammationPopulationGeneticsGenotypeGeneInternal medicineBiologyEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Associations between traffic‐related air pollution (TRAP) and childhood atopic dermatitis (AD) remain inconsistent, possibly due to unexplored gene‐environment interactions. The aim of this study was to examine whether a potential effect of TRAP on AD prevalence in children is modified by selected single nucleotide polymorphisms (SNPs) related to oxidative stress and inflammation. Methods Doctor‐diagnosed AD up to age 2 years and at 7‐8 years, as well as AD symptoms up to age 2 years, was assessed using parental‐reported questionnaires in six birth cohorts (N = 5685). Associations of nitrogen dioxide (NO2) estimated at the home address of each child at birth and nine SNPs within the GSTP1, TNF, TLR2, or TLR4 genes with AD were examined. Weighted genetic risk scores (GRS) were calculated from the above SNPs and used to estimate combined marginal genetic effects of oxidative stress and inflammation on AD and its interaction with TRAP. Results GRS was associated with childhood AD and modified the association between NO2 and doctor‐diagnosed AD up to the age of 2 years (P(interaction) = .029). This interaction was mainly driven by a higher susceptibility to air pollution in TNF rs1800629 minor allele (A) carriers. TRAP was not associated with the prevalence of AD in the general population. Conclusions The marginal genetic association of a weighted GRS from GSTP1, TNF, TLR2, and TLR4SNPs and its interaction with air pollution supports the role of oxidative stress and inflammation in AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePediatric Allergy and ImmunologyMême sujetDermatology and Skin DiseasesTravaux en français237 207