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Enregistrement W2796765042 · doi:10.1089/hum.2018.018

CRISPR/Cas9 Inhibits Multiple Steps of HIV-1 Infection

2018· article· en· W2796765042 sur OpenAlexafffund
Lijuan Yin, Siqi Hu, Shan Mei, Hong Sun, Fengwen Xu, Jian Li, Weijun Zhu, Xiaoman Liu, Fei Zhao, Di Zhang, Shan Cen, Chen Liang, Fei Guo

Notice bibliographique

RevueHuman Gene Therapy · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCas9CRISPRBiologyProvirusDNAPlasmidVirologyGeneGenome editingMolecular biologyGeneticsGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CRISPR/Cas9 is an adaptive immune system where bacteria and archaea have evolved to resist the invading viruses and plasmid DNA by creating site-specific double-strand breaks in DNA. This study tested this gene editing system in inhibiting human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection by targeting the viral long terminal repeat and the gene coding sequences. Strong inhibition of HIV-1 infection by Cas9/gRNA was observed, which resulted not only from insertions and deletions (indels) that were introduced into viral DNA due to Cas9 cleavage, but also from the marked decrease in the levels of the late viral DNA products and the integrated viral DNA. This latter defect might have reflected the degradation of viral DNA that has not been immediately repaired after Cas9 cleavage. It was further observed that Cas9, when solely located in the cytoplasm, inhibits HIV-1 as strongly as the nuclear Cas9, except that the cytoplasmic Cas9 does not act on the integrated HIV-1 DNA and thus cannot be used to excise the latent provirus. Together, the results suggest that Cas9/gRNA is able to target and edit HIV-1 DNA both in the cytoplasm and in the nucleus. The inhibitory effect of Cas9 on HIV-1 is attributed to both the indels in viral DNA and the reduction in the levels of viral DNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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