Characterization of an Alcohol Dehydrogenase of the Hyperthermophilic Archaeon Hyperthermus Butylicus
Notice bibliographique
Résumé
Hyperthermus butylicus is a peptide-fermenting hyperthermophilic archaeon producing 1-butanol as an end-product. The pathway for 1-butanol production in H. butylicus is unknown. Alcohol dehydrogenase (ADH) is a key enzyme responsible for alcohol production, which has to be present in H. butylicus, however, the gene encoding the enzyme is unknown. From the H. butylicus genome sequence, the gene Hbut_0414 is the only one annotated as an zinc-containing ADH, but it was unclear if it would be the enzyme catalyzing the production of 1-butanol. The gene was cloned and overexpressed in Escherichia coli. The recombinant enzyme encoded by Hbut_0414 was shown to be an NAD(H)-specific primary/secondary ADH capable of using a wide range of substrates including butyraldehyde and butanol. Optimal pH values for catalyzing aldehyde reduction and alcohol oxidation were of 5.0 and 8.5 respectively. Apparent Km values for acetaldehyde, propanal, acetone, butyraldehyde, ethanol, 1-propanol, 2-propanol and butanol were 0.61 ± 0.11, 0.41 ± 0.07, 1.41 ± 0.19, 1.75 ± 0.29, 1.79 ± 0.17, 2.30 ± 0.24, 4.85 ± 0.21 and 1.68 ± 0.15 mM, respectively. The specificity constant kcat/Km for propanal was the highest (15,975 s-1M-1) compared to that of butyraldehyde (1120 ± 345 s-1M-1). Its optimal temperature was found to be 60°C, and it lost 50% of its activity when incubated at 60°C for 3 hours, and 85% of its activity when incubated at 95°C for 5 min. It is unlikely that the ADH is functional for catalyzing the production of 1-butanol in H. butylicus growing optimally at 95°C. Further investigation is required for identifying the ADH responsible for catalyzing the 1-butanol production in this hypertehrmophilic archaeon.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».