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Enregistrement W2798732208 · doi:10.1101/306662

Estrogen receptor regulates hormone-induced growth arrest in a luminal A like breast cancer model

2018· preprint· en· W2798732208 sur OpenAlexaff
Lacey Haddon, S.C. Hu, Hosna Jabbari, Brittney Loney, Zelda-Saidman Lichtensztejn, Richard P. Fahlman, Mary Hitt, Kirk J. McManus, Kelly Dabbs, John R. Mackey, Judith Hugh

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEstrogenEstrogen receptorProgesterone receptorBreast cancerCancer researchBiologyInternal medicineChromatinEstrogen receptor alphaHormoneEndocrinologyEstrogen receptor betaBasal (medicine)Cell cycleCancerGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Estrogen receptor positive (ER+) breast cancer has been divided into two subtypes, luminal A and luminal B, which differ in their ER expression and response to hormone therapy. The absence of luminal A cell lines means the extensive amount of in vitro work studying the response to hormones in ER+ breast cancers is biased for the luminal B subtype. We have developed a luminal A like cell model by increasing the ER expression in the MCF-7 cell line. Our results show that increased ER expression promotes an anti-proliferative response to estrogen through regulation of genes involved in the G1/S-phase transition of the cell cycle. Furthermore, increased ER expression increases ER-DNA binding in the absence of estrogen and regulates basal gene transcription by promoting DNA looping. These results provide novel evidence that the characteristic increased ER expression of luminal A tumors may promote a novel chromatin configuration that enables growth of these tumors in the absence of estrogen and enables gene repression in the presence of hormones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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