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Enregistrement W2801645724 · doi:10.1371/journal.pgen.1007330

Moss genetics and the way forward

2018· letter· en· W2801645724 sur OpenAlexaff
Neil W. Ashton

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2018
Typeletter
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBryophyte Studies and Records
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMossGeneticsEvolutionary biologyHuman geneticsHuman evolutionary geneticsComputational biologyGenomeEcologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The moss Physcomitrella patens was originally chosen for the study of gene regulation in plant development Its gametophyte generation is haploid and exhibits an ordered sequence of developmental transitions facilitating the isolation and identification of mutants. The physiology associated with this sequence had been partially characterised in the closely related Funaria hygrometrica and, for example, shown to involve auxin [2] and cytokinin P. patens was preferred to F. hygrometrica because of the invaluable preliminary studies of Engel [4] and the short, approximately 8-week life cycle of P. patens in laboratory conditions. Consequently, pioneers of the P. patens plant model system envisaged using classical forward genetics for the dissection of developmental processes. Since protonemal tissue, the first tissue to be formed from a germinating moss spore, can be propagated vegetatively, the culture of mutants that were abnormal even at an early stage of development presented no problems-although when such mutants were sterile, orthodox genetic analysis was not possible. To circumvent this problem, somatic hybrids were made by protoplast fusion Perhaps the most complete early example of this forward genetics approach involved 15 sterile gametophore overproducing (ove) mutants Somatic hybridisation demonstrated that the ove phenotype is recessive in all but one case, and the ratio of mutant to wild-type postmeiotic segregants from self-fertilised hybrids was consistent with the altered phenotype being the result of a single mutation in each case tested. Recessive mutants were assigned to three complementation groups (oveA, B, and C) and the ratio of ove to wild-type segregants from a selfed oveA/oveB somatic hybrid showed that the two affected genes are unlinked The biochemical basis for the ove phenotype is an increased level of biologically active cytokinins, principally N 6 -( 2 -isopentenyl) adenine [8, 9]. However, mapping the ove mutations and identifying the genes affected and their corresponding proteins have yet to be achieved.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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