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Enregistrement W2801672340 · doi:10.1093/biosci/biy038

Management, Archiving, and Sharing for Biologists and the Role of Research Institutions in the Technology-Oriented Age

2018· article· en· W2801672340 sur OpenAlexaff
Sébastien Renaut, Amber E Budden, Dominique Gravel, Timothée Poisot, Pedro R. Peres‐Neto

Notice bibliographique

RevueBioScience · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueResearch Data Management Practices
Établissements canadiensConcordia UniversityUniversité de SherbrookeUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésData managementData sharingData scienceComputer scienceData curationDigital preservationTerm (time)Research dataWorld Wide WebDatabase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Data are one of the primary outputs of science. Although certain subdisciplines of biology have pioneered efforts to ensure their long-term preservation and facilitate collaborations, data continue to disappear, owing mostly to technological, regulatory, and ideological hurdles. In this article, we describe the important steps toward proper data management and archiving and provide a critical discussion on the importance of long-term data conservation. We then illustrate the rise in data archiving through the Joint Data Archiving Policy and the Dryad Digital Repository. In particular, we discuss data integration and how the limited availability of large-scale data sets can hinder new discoveries. Finally, we propose solutions to increase the rate of data preservation, for example by generating mechanisms insuring proper data management and archiving, by providing training in data management, and by transforming the traditional role of research institutions and libraries as data generators toward managers and archivers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,083
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,141
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCommunication savante, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,440

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0830,141
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0090,025
Études des sciences et des technologies0,0130,018
Communication savante0,0360,045
Science ouverte0,0060,016
Intégrité de la recherche0,0050,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,161
Tête enseignante GPT0,438
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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