Genetic Variability in the Hop-Tolerance <i>horC</i> Gene of Beer-Spoiling Lactic Acid Bacteria
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
horC is often targeted in rapid molecular tests for lactic acid bacteria (LAB) beer-spoilage ability. Discovery of a 27 bp horC deletion in a LAB unable to spoil beer led us to examine 27 horC+ isolates across two LAB genera and seven species to assess horC conservation. Nineteen (70%) of the isolates had the gap, with eight (30%) additionally containing a 3 bp gap yielding a cysteine excision and 14 conserved amino acid substitutions, thus defining three horC orthologs. Pediococcus-specific horC point mutations were also found. horC could not be sequenced in four cases (15%), pointing to horC paralog(s) indistinguishable by the original multiplex polymerase chain reaction (PCR). In contrast, the sequence of the putative horC transcriptional regulator horB was uniformly conserved, suggesting horB is essential for horC function. Modeling of protein structure and hop-compound binding revealed the horC orthologs produce proteins with similar function. Transcriptional analysis, however, found that between and within orthologs, horC expression was not proportional to the hops level present. Transcription analysis also suggested that horB repressed horC in the absence of hops. Thus, it is concluded that different horC orthologs are not uniformly active in response to hops, and targeting short gene sequences during PCR testing for LAB beer-spoilage potential is problematic.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle